RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527049.1

ZNF250-204, Transcript of zinc finger protein 250, humanhuman

TSL 3

Gene ZNF250, Length 610 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF250-204ENST00000527049 WRNIP1Q96S55 665 aa23.55■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 CENPFP49454 3210 aa23.54■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 TFCP2Q12800 502 aa23.54■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 MTX1Q13505 466 aa23.54■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.54■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.54■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.54■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.53■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.53■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 CAP1Q01518 475 aa23.53■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 TCP10Q12799 353 aa23.53■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 RASGRF1Q13972 1273 aa23.53■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 CCL15Q16663 113 aa23.53■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.53■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 TRIM17Q9Y577 477 aa23.53■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 A0A1B0GUL7 405 aa23.52■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 SEMA3EO15041 775 aa23.52■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 MIER1Q8N108 512 aa23.52■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23.52■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 FAM198AQ9UFP1 575 aa23.52■■□□□ 1.36
ZNF250-204ENST00000527049 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23.51■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 GTF2A2P52657 109 aa23.51■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.51■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.51■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 FAM151AQ8WW52 585 aa23.51■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 XAGE2Q96GT9 111 aa23.51■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.5■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 INPP5BP32019 993 aa23.5■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.5■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 USP40Q9NVE5 1235 aa23.5■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 GNAI2P04899 355 aa23.49■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 DCAF15Q66K64 600 aa23.49■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 ERO1BQ86YB8 467 aa23.49■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.49■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.49■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 IRF6O14896 467 aa23.48■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 HOOK2Q96ED9 719 aa23.48■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 ERO1AQ96HE7 468 aa23.48■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 ABCF2Q9UG63 623 aa23.48■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 ZBTB22O15209 634 aa23.47■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 SP3Q02447 781 aa23.47■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.47■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.47■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 GAKO14976 1311 aa23.47■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 BRCA2P51587 3418 aa23.46■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 PPIL2Q13356 520 aa23.46■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.46■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 PI16Q6UXB8 463 aa23.46■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
ZNF250-204ENST00000527049 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.45■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 BTBD19C9JJ37 291 aa23.45■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 RGS3P49796 1198 aa23.45■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.45■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 ATRNL1Q5VV63 1379 aa23.44■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 SLURP2P0DP57 97 aa23.44■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 CETPP11597 493 aa23.44■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 ZNF384Q8TF68 577 aa23.44■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 EFCC1Q9HA90 598 aa23.44■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.44■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.44■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.44■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 PTPN22Q9Y2R2 807 aa23.44■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 BTDP43251 543 aa23.43■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 SNAPC2Q13487 334 aa23.43■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.43■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.43■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 AK9Q5TCS8 1911 aa23.43■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 PPATQ06203 517 aa23.42■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 IDI2Q9BXS1 227 aa23.42■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.41■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 MECOMQ03112 1051 aa23.41■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.41■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 ENTPD3O75355 529 aa23.4■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 RLBP1P12271 317 aa23.4■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 GORABQ5T7V8 394 aa23.4■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.4■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 SPATA5Q8NB90 893 aa23.4■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ZNF250-204ENST00000527049 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.39■■□□□ 1.33
ZNF250-204ENST00000527049 DOCK2Q92608 1830 aa23.39■■□□□ 1.33
ZNF250-204ENST00000527049 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ZNF250-204ENST00000527049 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ZNF250-204ENST00000527049 PICALMQ13492 652 aa23.39■■□□□ 1.33
ZNF250-204ENST00000527049 POLA2Q14181 598 aa23.39■■□□□ 1.33
ZNF250-204ENST00000527049 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms