RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 STYK1Q6J9G0 422 aa27.41■■□□□ 1.98
ACER3-204ENST00000525861 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
ACER3-204ENST00000525861 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP27.41■■□□□ 1.98
ACER3-204ENST00000525861 CTDSPL2Q05D32 466 aa27.4■■□□□ 1.98
ACER3-204ENST00000525861 AKNAD1Q5T1N1 836 aa27.4■■□□□ 1.98
ACER3-204ENST00000525861 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
ACER3-204ENST00000525861 SCRN1Q12765 414 aa27.4■■□□□ 1.98
ACER3-204ENST00000525861 GIMAP6Q6P9H5 292 aa27.4■■□□□ 1.98
ACER3-204ENST00000525861 CNNM2Q9H8M5 875 aa27.4■■□□□ 1.98
ACER3-204ENST00000525861 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP27.4■■□□□ 1.98
ACER3-204ENST00000525861 STAG1Q8WVM7 1258 aa27.39■■□□□ 1.98
ACER3-204ENST00000525861 B4E1Z4 1266 aa27.39■■□□□ 1.97
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ACER3-204ENST00000525861 OLFM4Q6UX06 510 aa27.39■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 GSTO1P78417 241 aa27.38■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 PPARAQ07869 468 aa27.38■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 MFSD6Q6ZSS7 791 aa27.38■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 CYB5R4Q7L1T6 521 aa27.38■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 ANAPC4Q9UJX5 808 aa27.38■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 DTNBO60941 627 aa27.37■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 KRT23Q9C075 422 aa27.37■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 COA1Q9GZY4 146 aa27.37■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 PDCP20941 246 aa27.37■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 MCTP1Q6DN14 999 aa27.37■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 NKX2-3Q8TAU0 364 aa27.37■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 CHMP4CQ96CF2 233 aa27.37■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 TACC3Q9Y6A5 838 aa27.37■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 TRAK2O60296 914 aa27.36■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 GRIK5Q16478 980 aa27.36■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa27.36■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 TMEM87BQ96K49 555 aa27.36■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 FAM205AQ6ZU69 1335 aa27.35■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 INCENPQ9NQS7 918 aa27.35■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 RIMBP2O15034 1052 aa27.34■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa27.34■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa27.34■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 MTMR6Q9Y217 621 aa27.34■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 MINDY4BA8MYZ0 360 aa27.34■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 JAK2O60674 1132 aa27.34■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 LDHCP07864 332 aa27.34■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 CNKSR1Q969H4 720 aa27.34■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 BRPF3Q9ULD4 1205 aa27.34■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa27.33■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 KDM4AO75164 1064 aa27.33■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 CHRNA5P30532 468 aa27.33■■□□□ 1.97
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ACER3-204ENST00000525861 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 SLX4Q8IY92 1834 aa27.33■■□□□ 1.97
ACER3-204ENST00000525861 F13A1P00488 732 aa27.32■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 DIXDC1Q155Q3 683 aa27.32■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.32■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 ZSWIM5Q9P217 1185 aa27.32■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 CTR9Q6PD62 1173 aa27.32■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 EYA3Q99504 573 aa27.32■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa27.32■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 MYH2Q9UKX2 1941 aa27.32■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 BAG3O95817 575 aa27.31■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 PPP4CP60510 307 aa27.31■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa27.31■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 C10orf71Q711Q0 1435 aa27.31■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 CTDNEP1O95476 244 aa27.31■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 CCDC125Q86Z20 511 aa27.31■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 GOLGA8BA8MQT2 603 aa27.3■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 CERS3Q8IU89 383 aa27.3■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 CHAMP1Q96JM3 812 aa27.3■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 MTA3Q9BTC8 594 aa27.3■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 TOMM22Q9NS69 142 aa27.3■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 HPS5Q9UPZ3 1129 aa27.3■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 USP17L12C9JPN9 530 aa27.29■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 USP17L21D6R901 530 aa27.29■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 PCP11498 1178 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 GTF2IP78347 998 aa27.29■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa27.29■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 PTPDC1A2A3K4 754 aa27.29■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 LIFRP42702 1097 aa27.29■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 SGMS1Q86VZ5 419 aa27.29■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
ACER3-204ENST00000525861 LMBRD1Q9NUN5 540 aa27.29■■□□□ 1.96
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