RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525524.1

EDRF1-211, Transcript of erythroid differentiation regulatory factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene EDRF1, Length 462 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1-211ENST00000525524 CNTN3Q9P232 1028 aa6.48□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 SOX13Q9UN79 622 aa6.48□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.47□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 ZBTB39O15060 712 aa6.47□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 CYP26A1O43174 497 aa6.47□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.47□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.47□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 ABI1Q8IZP0 508 aa6.47□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 OSMRQ99650 979 aa6.47□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.47□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 CFAP74Q9C0B2 1584 aa6.47□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 HECW1Q76N89 1606 aa6.47□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa6.46□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 ATP2B4P23634 1241 aa6.46□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 CYP27A1Q02318 531 aa6.46□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 EHHADHQ08426 723 aa6.46□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 AAMPQ13685 434 aa6.46□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 FHOD3Q2V2M9 1422 aa6.46□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.46□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.46□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.46□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.46□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.46□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 NFKBIEO00221 500 aa6.45□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 PRNPP04156 253 aa6.45□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 F13BP05160 661 aa6.45□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 HELQQ8TDG4 1101 aa6.45□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.45□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.45□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa6.45□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa6.44□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 PHACTR2O75167 634 aa6.44□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 USP5P45974 858 aa6.44□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 MAP7Q14244 749 aa6.44□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 ATCAYQ86WG3 371 aa6.44□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 NXPE3Q969Y0 559 aa6.44□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 SAMD9Q5K651 1589 aa6.44□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 LTBP4Q8N2S1 1624 aa6.43□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 C3P01024 1663 aa6.43□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 PRXQ9BXM0 1461 aa6.43□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.43□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.43□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 TIAF1O95411 115 aa6.43□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 PDGFAP04085 211 aa6.43□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 ACPPP15309 386 aa6.43□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 GSTM4Q03013 218 aa6.43□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 MSMPQ1L6U9 139 aa6.43□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 FLCNQ8NFG4 579 aa6.43□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.43□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.43□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 MTMR7Q9Y216 660 aa6.43□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 C9orf84Q5VXU9 1444 aa6.42□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 SCAPERQ9BY12 1400 aa6.42□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 ATP10AO60312 1499 aa6.42□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 MAGI2Q86UL8 1455 aa6.42□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 TRPA1O75762 1119 aa6.42□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 ZAR1Q86SH2 424 aa6.42□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.42□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.42□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 PTPRTO14522 1441 aa6.42□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 BIN1O00499 593 aa6.41□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 OGFOD2Q6N063 350 aa6.41□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 GGNBP2Q9H3C7 697 aa6.41□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 RAD18Q9NS91 495 aa6.41□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.41□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 SEPT3Q9UH03 358 aa6.41□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa6.41□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 MYO5CQ9NQX4 1742 aa6.4□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 CYP11A1P05108 521 aa6.4□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.4□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.4□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 HHIPQ96QV1 700 aa6.4□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 CHRDQ9H2X0 955 aa6.4□□□□□ -1.38
EDRF1-211ENST00000525524 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
EDRF1-211ENST00000525524 EREGO14944 169 aa6.39□□□□□ -1.39
EDRF1-211ENST00000525524 DRD2P14416 443 aa6.39□□□□□ -1.39
EDRF1-211ENST00000525524 HGSNATQ68CP4 663 aa6.39□□□□□ -1.39
EDRF1-211ENST00000525524 CBLL1Q75N03 491 aa6.39□□□□□ -1.39
EDRF1-211ENST00000525524 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.39□□□□□ -1.39
EDRF1-211ENST00000525524 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.39□□□□□ -1.39
EDRF1-211ENST00000525524 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
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