RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524681.1

CTSW-202, Transcript of cathepsin W, humanhuman

TSL 2

Gene CTSW, Length 521 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-202ENST00000524681 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 CNTNAP1P78357 1384 aa8.98□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 SCN4AP35499 1836 aa8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 GSG1L2A8MUP6 293 aa8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 CDC45O75419 566 aa8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 NPM3O75607 178 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 BTDP43251 543 aa8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 GSTO1P78417 241 aa8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 NFIAQ12857 509 aa8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 VPS53Q5VIR6 699 aa8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 ZFPM1Q8IX07 1006 aa8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 IDI2Q9BXS1 227 aa8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 ARMT1Q9H993 441 aa8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.97□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 AK9Q5TCS8 1911 aa8.96□□□□□ -0.97
CTSW-202ENST00000524681 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.96□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 SMIM22K7EJ46 135 aa8.96□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 GPAA1O43292 621 aa8.96□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 MBD4O95243 580 aa8.96□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 LDHCP07864 332 aa8.96□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 POTEIP0CG38 1075 aa8.96□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 POTEJP0CG39 1038 aa8.96□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 PTH1RQ03431 593 aa8.96□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 EVX2Q03828 476 aa8.96□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.96□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 OGFOD1Q8N543 542 aa8.96□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 NMRK2Q9NPI5 230 aa8.96□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 TACC3Q9Y6A5 838 aa8.96□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa8.96□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 DCAF8L1A6NGE4 600 aa8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 H7C1D1 291 aa8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 HIP1O00291 1037 aa8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 EPHX2P34913 555 aa8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 CACNB3P54284 484 aa8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 DLGAP5Q15398 846 aa8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 ALX1Q15699 326 aa8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 FKBP1CQ5VVH2 108 aa8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 MAP4K1Q92918 833 aa8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 TEPSINQ96N21 525 aa8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 NBPF3Q9H094 633 aa8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 RRAGCQ9HB90 399 aa8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 USP40Q9NVE5 1235 aa8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 HACL1Q9UJ83 578 aa8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 FOCADQ5VW36 1801 aa8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 CCDC171Q6TFL3 1326 aa8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 RAD50Q92878 1312 aa8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 ATRNL1Q5VV63 1379 aa8.95□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 KIF3CO14782 793 aa8.94□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 MAP3K10Q02779 954 aa8.94□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 DLK2Q6UY11 383 aa8.94□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 SLF2Q8IX21 1173 aa8.94□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.94□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 SDR42E1Q8WUS8 393 aa8.94□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 KCNB2Q92953 911 aa8.94□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 BACH2Q9BYV9 841 aa8.94□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa8.94□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 HDAC9Q9UKV0 1011 aa8.94□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 TAF6LQ9Y6J9 622 aa8.94□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 ECM29Q5VYK3 1845 aa8.94□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 CLRN2A0PK11 232 aa8.93□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 IQCA1LA6NCM1 817 aa8.93□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 ENTPD3O75355 529 aa8.93□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 BAG3O95817 575 aa8.93□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 FGAP02671 866 aa8.93□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 FGRP09769 529 aa8.93□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 SLURP2P0DP57 97 aa8.93□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 NECTIN1Q15223 517 aa8.93□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 GIMAP6Q6P9H5 292 aa8.93□□□□□ -0.98
CTSW-202ENST00000524681 IFNL3Q8IZI9 196 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms