RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 KRT23Q9C075 422 aa26.78■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 CFAP45Q9UL16 551 aa26.78■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 TACC3Q9Y6A5 838 aa26.78■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa26.77■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 FOSBP53539 338 aa26.77■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 CPLX1O14810 134 aa26.77■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 NPHP1O15259 732 aa26.77■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 ADD1P35611 737 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 SGMS1Q86VZ5 419 aa26.77■■□□□ 1.88
PDE4D-223ENST00000515011 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 ATL3Q6DD88 541 aa26.76■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 APOA5Q6Q788 366 aa26.76■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 MFSD6Q6ZSS7 791 aa26.76■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 CNBD1Q8NA66 436 aa26.76■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 LY9Q9HBG7 655 aa26.76■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 PPFIA3O75145 1194 aa26.75■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa26.75■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 INCENPQ9NQS7 918 aa26.75■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.75■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 LIFRP42702 1097 aa26.75■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.75■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 RGS22Q8NE09 1264 aa26.75■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 ZSWIM5Q9P217 1185 aa26.75■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 KDM4AO75164 1064 aa26.74■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 TMEM67Q5HYA8 995 aa26.74■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 MAST2Q6P0Q8 1798 aa26.74■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 GRAPQ13588 217 aa26.74■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa26.73■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 LIG1P18858 919 aa26.73■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF384Q8TF68 577 aa26.73■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 SENP2Q9HC62 589 aa26.73■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa26.73■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.73■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 GUCY1B3Q02153 619 aa26.73■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 PGBD1Q96JS3 809 aa26.73■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 C8orf76Q96K31 380 aa26.73■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 MTA3Q9BTC8 594 aa26.73■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 ANAPC4Q9UJX5 808 aa26.73■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 PPARAQ07869 468 aa26.72■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 RNF214Q8ND24 703 aa26.72■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 FUCA2Q9BTY2 467 aa26.72■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 CDKL5O76039 1030 aa26.71■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.71■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 SDR42E1Q8WUS8 393 aa26.71■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 PDLIM2Q96JY6 352 aa26.71■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 RCOR1Q9UKL0 485 aa26.71■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 NID2Q14112 1375 aa26.71■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 ZBTB43O43298 467 aa26.71■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 GYS1P13807 737 aa26.71■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 NFXL1Q6ZNB6 911 aa26.71■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa26.71■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.7■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.7■■□□□ 1.87
PDE4D-223ENST00000515011 GIMAP6Q6P9H5 292 aa26.7■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 CDC27P30260 824 aa26.69■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 MICU3Q86XE3 530 aa26.69■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 USP28Q96RU2 1077 aa26.68■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 NUP62CLQ9H1M0 184 aa26.68■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.68■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 MECOMQ03112 1051 aa26.68■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.68■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC69A6NI79 296 aa26.67■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 GOLGA8AA7E2F4 631 aa26.67■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 RXRAP19793 462 aa26.67■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 SART3Q15020 963 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 DACT1Q9NYF0 836 aa26.67■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 SLC12A7Q9Y666 1083 aa26.67■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 NTRK3Q16288 839 aa26.67■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 UVSSAQ2YD98 709 aa26.67■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa26.67■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 BICD2Q8TD16 824 aa26.67■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 TOMM22Q9NS69 142 aa26.67■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 ECM29Q5VYK3 1845 aa26.67■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.66■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 CRY2Q49AN0 593 aa26.66■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 DUOX1Q9NRD9 1551 aa26.66■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 XDHP47989 1333 aa26.66■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 BRAPQ7Z569 592 aa26.65■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa26.65■■□□□ 1.86
PDE4D-223ENST00000515011 MINDY4BA8MYZ0 360 aa26.65■■□□□ 1.86
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