RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 MAPK1P28482 360 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 FCGRTP55899 365 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 KCNA1Q09470 495 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 AKAP4Q5JQC9 854 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 PDZD3Q86UT5 571 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 NFICP08651 508 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 GP2P55259 537 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 MSMPQ1L6U9 139 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 MCTP1Q6DN14 999 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 ZAR1Q86SH2 424 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF862O60290 1169 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 FOSL1P15407 271 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 DTHD1Q6ZMT9 781 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 DYMQ7RTS9 669 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 STK35Q8TDR2 534 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 ASB16Q96NS5 453 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 RAD18Q9NS91 495 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 KRT82Q9NSB4 513 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 TMPRSS2O15393 492 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 LIG1P18858 919 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 ASPAP45381 313 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 FBF1Q8TES7 1133 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 WNT11O96014 354 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 MAP7Q14244 749 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 FAM170BA6NMN3 283 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 PDE3AQ14432 1141 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 SETDB2Q96T68 719 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 PAX4O43316 350 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 RAB6AP20340 208 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 DISC1Q9NRI5 854 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 PRNPP04156 253 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 ARNTP27540 789 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 SULF2Q8IWU5 870 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 WWC3Q9ULE0 1092 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 SLFN14P0C7P3 912 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 NME2P22392 152 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 ID3Q02535 119 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 OGFOD3Q6PK18 319 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 AKAP2Q9Y2D5 859 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4D-217ENST00000509355 ENC1O14682 589 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 GIPC1O14908 333 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 BMP6P22004 513 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 MAPK8P45983 427 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF765Q7L2R6 523 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 NESP48681 1621 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 CYP26A1O43174 497 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 GSTT1P30711 240 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 CYP27A1Q02318 531 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-217ENST00000509355 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.63□□□□□ -1.03
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