RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507771.5

ITGA3-210, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 399 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-210ENST00000507771 USP40Q9NVE5 1235 aa13.41□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP13.41□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 DOCK2Q92608 1830 aa13.41□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa13.4□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 EGFRP00533 1210 aa13.4□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 SDSP20132 328 aa13.4□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 CASC1Q6TDU7 716 aa13.4□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 SULF1Q8IWU6 871 aa13.4□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 MIGA1Q8NAN2 632 aa13.4□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 APPBP2Q92624 585 aa13.4□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 GGA3Q9NZ52 723 aa13.4□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 MYH2Q9UKX2 1941 aa13.4□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 CLRN2A0PK11 232 aa13.39□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 TOMM70O94826 608 aa13.39□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 PPP4CP60510 307 aa13.39□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 SPDYE2Q495Y8 402 aa13.39□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 CHADLQ6NUI6 762 aa13.39□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 TEX11Q8IYF3 940 aa13.39□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF384Q8TF68 577 aa13.39□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 RUFY2Q8WXA3 655 aa13.39□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 DDRGK1Q96HY6 314 aa13.39□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa13.38□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 KIF3CO14782 793 aa13.38□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 USP5P45974 858 aa13.38□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 FKBP1CQ5VVH2 108 aa13.38□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa13.38□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 CDC37L1Q7L3B6 337 aa13.38□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 ADGRA1Q86SQ6 560 aa13.38□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 SKAP1Q86WV1 359 aa13.38□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 SMC1BQ8NDV3 1235 aa13.38□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 HELLSQ9NRZ9 838 aa13.38□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 PGAP2Q9UHJ9 254 aa13.38□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa13.38□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa13.38□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 MYH7P12883 1935 aa13.37□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 TCP10L2B9ZVM9 353 aa13.37□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 MBD4O95243 580 aa13.37□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 GNAT2P19087 354 aa13.37□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa13.37□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 KRT26Q7Z3Y9 468 aa13.37□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 AK9Q5TCS8 1911 aa13.37□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 PICALMQ13492 652 aa13.36□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa13.36□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 FAM83AQ86UY5 434 aa13.36□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 AMOTL1Q8IY63 956 aa13.36□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 HOOK2Q96ED9 719 aa13.36□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 IDI2Q9BXS1 227 aa13.36□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 ARMT1Q9H993 441 aa13.36□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 ECM29Q5VYK3 1845 aa13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 GPAA1O43292 621 aa13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 ENTPD3O75355 529 aa13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 CDC45O75419 566 aa13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 NPM3O75607 178 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 POTEIP0CG38 1075 aa13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 POTEJP0CG39 1038 aa13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 NF2P35240 595 aa13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 CACNB3P54284 484 aa13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 RHBDL3P58872 404 aa13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 LCORLQ8N3X6 602 aa13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 FAM151AQ8WW52 585 aa13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 OSBP2Q969R2 916 aa13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 NACAP1Q9BZK3 213 aa13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 DEFB129Q9H1M3 183 aa13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa13.35□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 APPP05067 770 aa13.34□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 TCP10Q12799 353 aa13.34□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 FSTL1Q12841 308 aa13.34□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 RASA3Q14644 834 aa13.34□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa13.34□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 USP48Q86UV5 1035 aa13.34□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 FAM227BQ96M60 508 aa13.34□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa13.34□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 RAD50Q92878 1312 aa13.34□□□□□ -0.27
ITGA3-210ENST00000507771 M0R2C6 588 aa13.33□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 HLA-DOAP06340 250 aa13.33□□□□□ -0.28
ITGA3-210ENST00000507771 CHMLP26374 656 aa13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms