RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
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PGGT1B-204ENST00000503638 LDHCP07864 332 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP16.23■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 MAGEB6Q8N7X4 407 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 TMOD2Q9NZR1 351 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 AKAP11Q9UKA4 1901 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 WNT10BO00744 389 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 CYP7A1P22680 504 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 LBX1P52954 281 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 SULF1Q8IWU6 871 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 PI4K2BQ8TCG2 481 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
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PGGT1B-204ENST00000503638 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa16.21■□□□□ 0.19
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PGGT1B-204ENST00000503638 BTDP43251 543 aa16.21■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 DEFB115Q30KQ5 88 aa16.21■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 HHIPL2Q6UWX4 724 aa16.21■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
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PGGT1B-204ENST00000503638 AOX1Q06278 1338 aa16.2■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 SALL3Q9BXA9 1300 aa16.2■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 RGS3P49796 1198 aa16.2■□□□□ 0.18
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PGGT1B-204ENST00000503638 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa16.2■□□□□ 0.18
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PGGT1B-204ENST00000503638 TCP10L2B9ZVM9 353 aa16.19■□□□□ 0.18
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PGGT1B-204ENST00000503638 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP16.19■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
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PGGT1B-204ENST00000503638 CDC37L1Q7L3B6 337 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 SKAP1Q86WV1 359 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 KBTBD3Q8NAB2 608 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 EVI5LQ96CN4 794 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 MRIQ9BWK5 157 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF532Q9HCE3 1301 aa16.18■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 TNNI2P48788 182 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 TNFAIP1Q13829 316 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF384Q8TF68 577 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 MYH2Q9UKX2 1941 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 GAKO14976 1311 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAF5O00463 557 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 IGSF3O75054 1194 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 PICALMQ13492 652 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 CST9Q5W186 159 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 ADGRA1Q86SQ6 560 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 TEX11Q8IYF3 940 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 OSBPL3Q9H4L5 887 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 PLCG2P16885 1265 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 ADD2P35612 726 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 TCP10Q12799 353 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 SLFNL1Q499Z3 407 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 TTC22Q5TAA0 569 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 DOCK2Q92608 1830 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-204ENST00000503638 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 USP5P45974 858 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-204ENST00000503638 POTEHQ6S545 545 aa16.14■□□□□ 0.17
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