RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497768.7

TATDN3-204, Transcript of TatD DNase domain containing 3, human

TSL 5

Gene TATDN3, Length 302 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TATDN3-204	ENST00000497768	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	TEAD4	Q15561	434 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	ZNF790	Q6PG37	636 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	PGBD3	Q8N328	593 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	MRS2	Q9HD23	443 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	MTMR7	Q9Y216	660 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	PAPPA	Q13219	1627 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	NOS2	P35228	1153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	RFC4	P35249	363 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	SLC39A6	Q13433	755 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	MSL1	Q68DK7	614 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	USP3	Q9Y6I4	520 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	SBF2	Q86WG5	1849 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	BTBD11	A6QL63	1104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	EML1	O00423	815 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	C21orf2	O43822	256 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	GRIN3B	O60391	1043 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	MMP10	P09238	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	GYS1	P13807	737 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	VEGFB	P49765	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	NFE2L2	Q16236	605 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	OCLN	Q16625	522 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	HIF1A	Q16665	826 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	SMIM5	Q71RC9	77 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	GPAM	Q9HCL2	828 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	BTAF1	O14981	1849 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768	MRC1	P22897	1456 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TATDN3-204	ENST00000497768		A0A087WZG4	1122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768		H7C1W4	665 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	F11	P03951	625 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	MSX1	P28360	303 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	TM4SF1	P30408	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	TGFB2	P61812	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	GPR162	Q16538	588 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	EFHC2	Q5JST6	749 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	LCE2C	Q5TA81	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	MCM10	Q7L590	875 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	NARF	Q9UHQ1	456 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	CASZ1	Q86V15	1759 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	SLC35F4	A4IF30	521 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	CARNS1	A5YM72	827 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	KCNQ3	O43525	872 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	ATP4A	P20648	1035 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	ITGA6	P23229	1130 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	YY1	P25490	414 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	TXLNA	P40222	546 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	RTN1	Q16799	776 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TATDN3-204	ENST00000497768	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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