RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 PRDX5P30044 214 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 TCP10Q12799 353 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 CCDC102BQ68D86 513 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 SLF2Q8IX21 1173 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 PTPN18Q99952 460 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 USP40Q9NVE5 1235 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 GNAI2P04899 355 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 TIMM10P62072 90 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 SP3Q02447 781 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 ARHGEF6Q15052 776 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 ERO1BQ86YB8 467 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 MS4A4AQ96JQ5 239 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 MYH2Q9UKX2 1941 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 SPDYE5A6NIY4 337 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 TRIM27P14373 513 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 ADORA1P30542 326 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 ABCF2Q9UG63 623 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 A0A1B0GUL7 405 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 BCAR3O75815 825 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 CETPP11597 493 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 MTX1Q13505 466 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 GORABQ5T7V8 394 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 TFCP2Q12800 502 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 SNAPC2Q13487 334 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 EFCC1Q9HA90 598 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.582e-23■□□□□ 11
ACTB-212ENST00000484841 XAGE2Q96GT9 111 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB22O15209 634 aa24.89■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 PPATQ06203 517 aa24.89■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 PPIL2Q13356 520 aa24.89■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 RASGRF1Q13972 1273 aa24.89■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.89■■□□□ 1.58
ACTB-212ENST00000484841 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 IRF6O14896 467 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 NFIAQ12857 509 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 INPP5BP32019 993 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 KIF22Q14807 665 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 FAM198AQ9UFP1 575 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 TNNQ9UQP3 1299 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 DOCK2Q92608 1830 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 ENTPD3O75355 529 aa24.85■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 RGS3P49796 1198 aa24.85■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.85■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 GAKO14976 1311 aa24.85■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 LDHCP07864 332 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 GSTO1P78417 241 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 MIER1Q8N108 512 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 IDI2Q9BXS1 227 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 ZNF112Q9UJU3 913 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.83■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 BTBD19C9JJ37 291 aa24.83■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 TLR2O60603 784 aa24.83■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 BTDP43251 543 aa24.83■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 SPATA5Q8NB90 893 aa24.83■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
ACTB-212ENST00000484841 PICALMQ13492 652 aa24.82■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 PICK1Q9NRD5 415 aa24.82■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 RAI14Q9P0K7 980 aa24.82■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa24.82■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.81■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 MECOMQ03112 1051 aa24.81■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 ZFPM1Q8IX07 1006 aa24.81■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 HMG20BQ9P0W2 317 aa24.81■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 NBPF11Q86T75 865 aa24.8■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.79■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD23Q86SG2 305 aa24.79■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.79■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.79■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 PDHXO00330 501 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
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