RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482489.5

ING4-212, Transcript of inhibitor of growth family member 4, human

TSL 3

Gene ING4, Length 659 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ING4-212	ENST00000482489	HOOK2	Q96ED9	719 aa		15.25	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	MUC3A	Q02505	3323 aa		15.25	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		15.24	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	FLT3LG	P49771	235 aa		15.24	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	IRF5	Q13568	498 aa		15.24	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	FAM83A	Q86UY5	434 aa		15.24	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		15.24	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	IFT57	Q9NWB7	429 aa		15.24	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		15.24	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	PTPRF	P10586	1907 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	CACNB3	P54284	484 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	GCKR	Q14397	625 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	DCAF15	Q66K64	600 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	GUCD1	Q96NT3	240 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		15.23	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	INPP5B	P32019	993 aa		15.22	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		15.22	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	POTEB2	H3BUK9	544 aa		15.21	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	CYP2C8	P10632	490 aa		15.21	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	SYN1	P17600	705 aa		15.21	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		15.21	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
ING4-212	ENST00000482489	TTC28	Q96AY4	2481 aa		15.21	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	GNAI1	P63096	354 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	GRIK5	Q16478	980 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	15.2	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		15.2	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	CDH23	Q9H251	3354 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	TEKT1	Q969V4	418 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	NBPF3	Q9H094	633 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	AK9	Q5TCS8	1911 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	CXCL11	O14625	94 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	GYG1	P46976	350 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	FOXO4	P98177	505 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	UBE4A	Q14139	1066 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	TSPYL6	Q8N831	410 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	MRI	Q9BWK5	157 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	DOCK2	Q92608	1830 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	CACNA1F	O60840	1977 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	PLIN1	O60240	522 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	G2E3	Q7L622	706 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	LINS1	Q8NG48	757 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	STK31	Q9BXU1	1019 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		15.15	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	HMGCR	P04035	888 aa		15.15	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	RALBP1	Q15311	655 aa		15.15	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		15.15	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	PLXNB2	O15031	1838 aa		15.15	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	PFAS	O15067	1338 aa		15.15	■□□□□ 0.02
ING4-212	ENST00000482489	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		15.14	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		15.14	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	FAM151A	Q8WW52	585 aa		15.14	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	COA7	Q96BR5	231 aa		15.14	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		15.14	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		15.14	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		15.14	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	DOCK1	Q14185	1865 aa		15.14	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	COL9A1	P20849	921 aa		15.13	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	15.13	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		15.13	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		15.13	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		15.13	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	FAM161B	Q96MY7	647 aa		15.13	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		15.13	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	MAST3	O60307	1309 aa		15.13	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	15.12	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		15.12	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		15.12	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		15.12	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	15.12	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	15.12	■□□□□ 0.01
ING4-212	ENST00000482489	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	15.12	■□□□□ 0.01

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