RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468570.1

SGIP1-208, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, human

TSL 3

Gene SGIP1, Length 324 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SGIP1-208	ENST00000468570	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	ABTB2	Q8N961	1025 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	KCNK12	Q9HB15	430 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	ITIH2	P19823	946 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	PRKCQ	Q04759	706 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	NETO1	Q8TDF5	533 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	RAD18	Q9NS91	495 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SGIP1-208	ENST00000468570	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	INHBB	P09529	407 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	MTMR3	Q13615	1198 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	AOC3	Q16853	763 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	FYB2	Q5VWT5	728 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	PHACTR2	O75167	634 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	MPST	P25325	297 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	CTSW	P56202	376 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	PCDH1	Q08174	1060 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	POU4F3	Q15319	338 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	XKR5	Q6UX68	686 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	POLI	Q9UNA4	740 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	GRIA4	P48058	902 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	PDE3A	Q14432	1141 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	WDR18	Q9BV38	432 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	TNFRSF21	O75509	655 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	LIG1	P18858	919 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	HOXA5	P20719	270 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570		A0A096LPE4	126 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570		A0A1W2PPZ6	126 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	TMPRSS2	O15393	492 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	AOC2	O75106	756 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	CEACAM5	P06731	702 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	EDN3	P14138	238 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	OXCT1	P55809	520 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	DIRC2	Q96SL1	478 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	CORO1B	Q9BR76	489 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SGIP1-208	ENST00000468570	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	TTC16	Q8NEE8	873 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	RELT	Q969Z4	430 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	CYP11A1	P05108	521 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	PCSK2	P16519	638 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	ATP2B4	P23634	1241 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	IKZF1	Q13422	519 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	TTLL4	Q14679	1199 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	CSRNP1	Q96S65	589 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	TCF12	Q99081	682 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	CD320	Q9NPF0	282 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570		A0A1W2PP55	124 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	ZP2	Q05996	745 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	AAMP	Q13685	434 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	GGN	Q86UU5	652 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	PMEPA1	Q969W9	287 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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