RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464936.5

CEP170-209, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 5

Gene CEP170, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-209	ENST00000464936	USP17L22	D6RA61	530 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	USP17L19	D6RCP7	530 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	USP17L20	D6RJB6	530 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	NID1	P14543	1247 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	USP17L24	Q0WX57	530 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	RTN1	Q16799	776 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	STK32A	Q8WU08	396 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	ABCA3	Q99758	1704 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	KIAA0232	Q92628	1395 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	NRAP	Q86VF7	1730 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	CPB1	P15086	417 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	C1QTNF8	P60827	252 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	RAC1	P63000	192 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	PTK7	Q13308	1070 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	CCIN	Q13939	588 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	GSX2	Q9BZM3	304 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	PIK3C2G	O75747	1445 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	UTRN	P46939	3433 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	ZBTB7A	O95365	584 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	EPB42	P16452	691 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	IDH3A	P50213	366 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	DGKZ	Q13574	1117 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	FAM35A	Q86V20	835 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936		A0A0A0MRY4	1105 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	ITGB7	P26010	798 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	RGS22	Q8NE09	1264 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	BCS1L	Q9Y276	419 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	USP20	Q9Y2K6	914 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	SSH2	Q76I76	1423 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	SASH3	O75995	380 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	IGFBP4	P22692	258 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	STK32B	Q9NY57	414 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	NAGPA	Q9UK23	515 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	RREB1	Q92766	1687 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	C9orf172	C9J069	976 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	GPR162	Q16538	588 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	6.53	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	SYT17	Q9BSW7	474 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	CEP350	Q5VT06	3117 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CEP170-209	ENST00000464936	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	MICAL2	O94851	1124 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	RARA	P10276	462 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	ELN	P15502	786 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	SELP	P16109	830 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	ARSD	P51689	593 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	IER5	Q5VY09	327 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	ALS2	Q96Q42	1657 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	PLSCR1	O15162	318 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	DYRK3	O43781	588 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	SSFA2	P28290	1259 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	INPP5B	P32019	993 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	MBTPS1	Q14703	1052 aa		6.51	□□□□□ -1.37

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