RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437188.1

RPSAP28-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP28, Length 874 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP28-201ENST00000437188 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.67□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 TSKSQ9UJT2 592 aa11.67□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa11.67□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 WDR19Q8NEZ3 1342 aa11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 GOLIM4O00461 696 aa11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 TRAF5O00463 557 aa11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 PFKFB2O60825 505 aa11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 OFD1O75665 1012 aa11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 GPTP24298 496 aa11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 MAP3K11Q16584 847 aa11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 ATG9AQ7Z3C6 839 aa11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 LARGE2Q8N3Y3 721 aa11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 NECAB1Q8N987 351 aa11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 CAPNS2Q96L46 248 aa11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 SPATA32Q96LK8 384 aa11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 NUP62CLQ9H1M0 184 aa11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 ZBTB3Q9H5J0 574 aa11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 MYH7P12883 1935 aa11.66□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 MYH3P11055 1940 aa11.65□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 A0A1B0GUL7 405 aa11.65□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 CTAGE5O15320 804 aa11.65□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 TTLL7Q6ZT98 887 aa11.65□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 Q6ZUG5 572 aa11.65□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 FBXL16Q8N461 479 aa11.65□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 GDPD2Q9HCC8 539 aa11.65□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
RPSAP28-201ENST00000437188 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa11.64□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 AOC2O75106 756 aa11.64□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 PSMD1Q99460 953 aa11.64□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 NYXQ9GZU5 481 aa11.64□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 LAMA4Q16363 1823 aa11.64□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 MYH15Q9Y2K3 1946 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 ERVV-1B6SEH8 477 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 CSF1RP07333 972 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 CYP21A2P08686 494 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 ECE1P42892 770 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 SCNN1DP51172 638 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 CST9Q5W186 159 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 RNF214Q8ND24 703 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 APPBP2Q92624 585 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 AGXT2Q9BYV1 514 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 USP25Q9UHP3 1055 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 COL4A5P29400 1685 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 PPIP5K2O43314 1243 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 KDM4AO75164 1064 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 TRDNQ13061 729 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 ATP2B3Q16720 1220 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 SUSD4Q5VX71 490 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 CDC37L1Q7L3B6 337 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 NIM1KQ8IY84 436 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 BRF1Q92994 677 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 TNMDQ9H2S6 317 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 ZNF408Q9H9D4 720 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 LTBP1Q14766 1721 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 NUP98P52948 1817 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 TIMM10P62072 90 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 ST3GAL1Q11201 340 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 STK3Q13188 491 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 AOC3Q16853 763 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 WASHC4Q2M389 1173 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 CRY2Q49AN0 593 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 METTL24Q5JXM2 366 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 SASS6Q6UVJ0 657 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 C3orf67Q6ZVT6 689 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 FAM200AQ8TCP9 573 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 BICD2Q8TD16 824 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
RPSAP28-201ENST00000437188 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 142.7 ms