RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 MMP10P09238 476 aa19.55■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 SPATA32Q96LK8 384 aa19.55■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 NLRP3Q96P20 1036 aa19.55■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 CPA1P15085 419 aa19.54■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 KRBA2Q6ZNG9 492 aa19.54■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa19.54■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 TMCO3Q6UWJ1 677 aa19.54■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 SYT10Q6XYQ8 523 aa19.54■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 GPS2Q13227 327 aa19.53■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa19.53■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 ATP8B1O43520 1251 aa19.53■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 DTNBO60941 627 aa19.53■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 NR1I2O75469 434 aa19.53■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 PDCP20941 246 aa19.53■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 NOP2P46087 812 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 ST3GAL1Q11201 340 aa19.53■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 CDC37L1Q7L3B6 337 aa19.53■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 FERMT3Q86UX7 667 aa19.53■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 TEX2Q8IWB9 1127 aa19.53■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP19.53■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 TUBB4AP04350 444 aa19.52■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 TNNI3KQ59H18 835 aa19.52■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 FAM173BQ6P4H8 233 aa19.52■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 AACSQ86V21 672 aa19.52■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa19.52■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF609O15014 1411 aa19.52■□□□□ 0.72
CNGA3-205ENST00000436404 GSDMDP57764 484 aa19.52■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 ST5P78524 1137 aa19.52■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 CTR9Q6PD62 1173 aa19.52■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 VGLL2Q8N8G2 317 aa19.52■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 UBXN6Q9BZV1 441 aa19.52■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 TM6SF1Q9BZW5 370 aa19.52■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 ME3Q16798 604 aa19.51■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 CRY2Q49AN0 593 aa19.51■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa19.51■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 MYO1CO00159 1063 aa19.51■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 LRRN4CLQ8ND94 238 aa19.51■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa19.51■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 SMARCE1Q969G3 411 aa19.5■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 ZSCAN26Q16670 478 aa19.5■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 PI4K2BQ8TCG2 481 aa19.5■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 GPR108Q9NPR9 543 aa19.5■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 CNNM1Q9NRU3 951 aa19.5■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 PARP3Q9Y6F1 533 aa19.5■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 NECAB1Q8N987 351 aa19.49■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 BICD2Q8TD16 824 aa19.49■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 CASQ1P31415 396 aa19.49■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 ARAP2Q8WZ64 1704 aa19.49■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 UBXN4Q92575 508 aa19.49■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 ILDR2Q71H61 639 aa19.48■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 CNTROBQ8N137 903 aa19.48■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa19.48■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 CEP126Q9P2H0 1117 aa19.48■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 BECN2A8MW95 431 aa19.48■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 C10orf67Q8IYJ2 551 aa19.48■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 PGBD1Q96JS3 809 aa19.48■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 MPHOSPH8Q99549 860 aa19.48■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 TIMM10P62072 90 aa19.47■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 STX1AQ16623 288 aa19.47■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 ADCK5Q3MIX3 580 aa19.47■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 METTL24Q5JXM2 366 aa19.47■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa19.47■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 KCNB2Q92953 911 aa19.47■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 DBNDD2Q9BQY9 259 aa19.47■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 BRIP1Q9BX63 1249 aa19.47■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 IMPACTQ9P2X3 320 aa19.47■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 TTC41PQ6P2S7 1318 aa19.47■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 MROH5Q6ZUA9 1318 aa19.47■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 TPM1P09493 284 aa19.46■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 SLC16A10Q8TF71 515 aa19.46■□□□□ 0.71
CNGA3-205ENST00000436404 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms