RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426304.5

NHEJ1-204, Transcript of non-homologous end joining factor 1, human

TSL 3

Gene NHEJ1, Length 753 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NHEJ1-204	ENST00000426304	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
NHEJ1-204	ENST00000426304	ITGA6	P23229	1130 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NHEJ1-204	ENST00000426304	RFC5	P40937	340 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NHEJ1-204	ENST00000426304	KCNJ4	P48050	445 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NHEJ1-204	ENST00000426304	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
NHEJ1-204	ENST00000426304	GTF2I	P78347	998 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NHEJ1-204	ENST00000426304	PRKG1	Q13976	671 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NHEJ1-204	ENST00000426304	ARHGEF6	Q15052	776 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NHEJ1-204	ENST00000426304	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
NHEJ1-204	ENST00000426304	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
NHEJ1-204	ENST00000426304	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NHEJ1-204	ENST00000426304	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NHEJ1-204	ENST00000426304	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NHEJ1-204	ENST00000426304	NLRP7	Q8WX94	980 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NHEJ1-204	ENST00000426304	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
NHEJ1-204	ENST00000426304	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NHEJ1-204	ENST00000426304	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NHEJ1-204	ENST00000426304	CD209	Q9NNX6	404 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NHEJ1-204	ENST00000426304	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NHEJ1-204	ENST00000426304	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		10.02	□□□□□ -0.8
NHEJ1-204	ENST00000426304	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	10.02	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	CSF1R	P07333	972 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	CHRND	Q07001	517 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	TNFAIP1	Q13829	316 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	EFCC1	Q9HA90	598 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	OTOF	Q9HC10	1997 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	APAF1	O14727	1248 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	IL1R1	P14778	569 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	KLRK1	P26718	216 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	CLCN6	P51797	869 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	SP3	Q02447	781 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	GCKR	Q14397	625 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	RETREG2	Q8NC44	543 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	POTEF	A5A3E0	1075 aa		10	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	CASP7	P55210	303 aa		10	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	CRHR2	Q13324	411 aa		10	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	CCDC27	Q2M243	656 aa		10	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	CFAP100	Q494V2	611 aa		10	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		10	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		10	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	CERS5	Q8N5B7	392 aa		10	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	LINS1	Q8NG48	757 aa		10	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		10	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		10	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		10	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	NBPF11	Q86T75	865 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	TSPYL6	Q8N831	410 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	ZNF333	Q96JL9	665 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	VEZT	Q9HBM0	779 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	GJA5	P36382	358 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	RASA3	Q14644	834 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	IL16	Q14005	1332 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	CLRN2	A0PK11	232 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	GNRH1	P01148	92 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	TNNI2	P48788	182 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	9.97	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	GTF2A2	P52657	109 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	PRMT2	P55345	433 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	PADI6	Q6TGC4	694 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	OPTN	Q96CV9	577 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	PTPN18	Q99952	460 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304	FZD1	Q9UP38	647 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NHEJ1-204	ENST00000426304		F8W031	263 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
NHEJ1-204	ENST00000426304	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
NHEJ1-204	ENST00000426304	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	9.96	□□□□□ -0.82
NHEJ1-204	ENST00000426304	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
NHEJ1-204	ENST00000426304	CSAD	Q9Y600	493 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NHEJ1-204	ENST00000426304	TAF5L	O75529	589 aa		9.95	□□□□□ -0.82
NHEJ1-204	ENST00000426304	UBE4A	Q14139	1066 aa		9.95	□□□□□ -0.82
NHEJ1-204	ENST00000426304	KIF22	Q14807	665 aa		9.95	□□□□□ -0.82
NHEJ1-204	ENST00000426304	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		9.95	□□□□□ -0.82
NHEJ1-204	ENST00000426304	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		9.95	□□□□□ -0.82
NHEJ1-204	ENST00000426304	G2E3	Q7L622	706 aa		9.95	□□□□□ -0.82

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