RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421185.1

RTCA-AS1-201, RTCA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RTCA-AS1, Length 423 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MPHOSPH8Q99549 860 aa11.1□□□□□ -0.63
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PFASO15067 1338 aa11.09□□□□□ -0.63
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ECM29Q5VYK3 1845 aa11.09□□□□□ -0.63
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CXCL11O14625 94 aa11.09□□□□□ -0.63
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HOXB7P09629 217 aa11.09□□□□□ -0.63
RTCA-AS1-201ENST00000421185 COL6A1P12109 1028 aa11.09□□□□□ -0.63
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MOGSQ13724 837 aa11.09□□□□□ -0.63
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MYD88Q99836 296 aa11.09□□□□□ -0.63
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF341Q9BYN7 854 aa11.09□□□□□ -0.63
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GREM2Q9H772 168 aa11.09□□□□□ -0.63
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LRRC26Q2I0M4 334 aa11.08□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GPAT2Q6NUI2 795 aa11.08□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa11.08□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SHHQ15465 462 aa11.07□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FAM83AQ86UY5 434 aa11.07□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 USP38Q8NB14 1042 aa11.07□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PLEKHF1Q96S99 279 aa11.07□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TMOD2Q9NZR1 351 aa11.07□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 THEGQ9P2T0 379 aa11.07□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa11.07□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FKBP1CQ5VVH2 108 aa11.06□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LRFN3Q9BTN0 628 aa11.06□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CDH23Q9H251 3354 aa11.06□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 INPP5BP32019 993 aa11.05□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CRKP46108 304 aa11.05□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CHRNDQ07001 517 aa11.05□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LMOD3Q0VAK6 560 aa11.05□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MFSD14BQ5SR56 506 aa11.05□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF112Q9UJU3 913 aa11.05□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 BDP1A6H8Y1 2624 aa11.05□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MGAMO43451 1857 aa11.04□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PPP2R1AP30153 589 aa11.04□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RIPK4P57078 832 aa11.04□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MIGA2Q7L4E1 593 aa11.04□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 JAG2Q9Y219 1238 aa11.04□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CHL1O00533 1208 aa11.03□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DDX58O95786 925 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ITGA6P23229 1130 aa11.03□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TRIM32Q13049 653 aa11.03□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GRIN2CQ14957 1233 aa11.03□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FAM110CQ1W6H9 321 aa11.03□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KRT24Q2M2I5 525 aa11.03□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TMEM31Q5JXX7 168 aa11.03□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 C9orf50Q5SZB4 431 aa11.03□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 AKNAD1Q5T1N1 836 aa11.03□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa11.03□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GJD2Q9UKL4 321 aa11.03□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PDE3AQ14432 1141 aa11.02□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa11.02□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GADL1Q6ZQY3 521 aa11.02□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PPM1EQ8WY54 764 aa11.02□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MRIQ9BWK5 157 aa11.02□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PNMA3Q9UL41 463 aa11.02□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DLG5Q8TDM6 1919 aa11.01□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TAF5LO75529 589 aa11.01□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CACNB3P54284 484 aa11.01□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TEKT1Q969V4 418 aa11.01□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZHX2Q9Y6X8 837 aa11.01□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MUC6Q6W4X9 2439 aa11□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SNAP23O00161 211 aa11□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LHX8Q68G74 356 aa11□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF576Q9H609 170 aa11□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PICK1Q9NRD5 415 aa11□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ARAP2Q8WZ64 1704 aa10.99□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa10.99□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MRE11P49959 708 aa10.99□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NEXNQ0ZGT2 675 aa10.99□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 AAK1Q2M2I8 961 aa10.99□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DUSP27Q5VZP5 1158 aa10.99□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FAM151AQ8WW52 585 aa10.99□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TRIB2Q92519 343 aa10.99□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZDHHC15Q96MV8 337 aa10.99□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PLA2G12BQ9BX93 195 aa10.99□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CHMP4AQ9BY43 222 aa10.99□□□□□ -0.65
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms