RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.25■□□□□ 0.83
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.25■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZMYM6O95789 1325 aa20.25■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 APPP05067 770 aa20.24■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 ALX1Q15699 326 aa20.24■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.24■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 GJA3Q9Y6H8 435 aa20.24■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCN9AQ15858 1988 aa20.24■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.23■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.23■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 FOXP2O15409 715 aa20.23■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSPA4P34932 840 aa20.23■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF20Q5VTR2 975 aa20.23■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.23■□□□□ 0.83
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CHD4Q14839 1912 aa20.23■□□□□ 0.83
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANAPC15P60006 121 aa20.22■□□□□ 0.83
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TOP3BP1-201ENST00000420768 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.22■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.21■□□□□ 0.83
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TOP3BP1-201ENST00000420768 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.21■□□□□ 0.83
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.21■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAPBQ9H115 298 aa20.21■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP40Q9NVE5 1235 aa20.21■□□□□ 0.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSME4Q14997 1843 aa20.2■□□□□ 0.82
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TOP3BP1-201ENST00000420768 USP5P45974 858 aa20.2■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 TDO2P48775 406 aa20.2■□□□□ 0.82
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.2■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNB2Q92953 911 aa20.2■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL17RAQ96F46 866 aa20.2■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.2■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYH7P12883 1935 aa20.19■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.19■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC27A2O14975 620 aa20.19■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 MICALL2Q8IY33 904 aa20.19■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 H7C1D1 291 aa20.18■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF213O14771 459 aa20.18■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSGA10IPQ3SY00 556 aa20.18■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.18■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.18■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYO1BO43795 1136 aa20.17■□□□□ 0.82
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TOP3BP1-201ENST00000420768 IDI2Q9BXS1 227 aa20.17■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYP21A2P08686 494 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRT32Q14532 448 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 SBK1Q52WX2 424 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 PALD1Q9ULE6 856 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 FLT1P17948 1338 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTR9Q6PD62 1173 aa20.15■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 RASEFQ8IZ41 740 aa20.15■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL27Q8NEV9 243 aa20.15■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.15■□□□□ 0.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 GLTPD2A6NH11 291 aa20.14■□□□□ 0.81
TOP3BP1-201ENST00000420768 WNT10BO00744 389 aa20.14■□□□□ 0.81
TOP3BP1-201ENST00000420768 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.14■□□□□ 0.81
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.14■□□□□ 0.81
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF2CQ99661 725 aa20.14■□□□□ 0.81
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.14■□□□□ 0.81
TOP3BP1-201ENST00000420768 SHTN1A0MZ66 631 aa20.13■□□□□ 0.81
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP17L12C9JPN9 530 aa20.13■□□□□ 0.81
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP17L21D6R901 530 aa20.13■□□□□ 0.81
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