RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 CERKQ8TCT0 537 aa23.59■■□□□ 1.37
SUMO3-204ENST00000411651 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.59■■□□□ 1.37
SUMO3-204ENST00000411651 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SUMO3-204ENST00000411651 CYP7A1P22680 504 aa23.59■■□□□ 1.37
SUMO3-204ENST00000411651 RFC4P35249 363 aa23.59■■□□□ 1.37
SUMO3-204ENST00000411651 TDO2P48775 406 aa23.59■■□□□ 1.37
SUMO3-204ENST00000411651 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
SUMO3-204ENST00000411651 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.59■■□□□ 1.37
SUMO3-204ENST00000411651 C8orf76Q96K31 380 aa23.59■■□□□ 1.37
SUMO3-204ENST00000411651 LY9Q9HBG7 655 aa23.59■■□□□ 1.37
SUMO3-204ENST00000411651 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SUMO3-204ENST00000411651 TAF1P21675 1872 aa23.58■■□□□ 1.37
SUMO3-204ENST00000411651 ESPNB1AK53 854 aa23.58■■□□□ 1.37
SUMO3-204ENST00000411651 TM4SF1P30408 202 aa23.58■■□□□ 1.37
SUMO3-204ENST00000411651 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.58■■□□□ 1.37
SUMO3-204ENST00000411651 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.57■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 CLCN1P35523 988 aa23.57■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 MAP3K11Q16584 847 aa23.57■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 TMTC2Q8N394 836 aa23.57■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 PGBD1Q96JS3 809 aa23.57■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 STK36Q9NRP7 1315 aa23.57■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC192P0DO97 292 aa23.57■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.57■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 RAI14Q9P0K7 980 aa23.57■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 ZBTB43O43298 467 aa23.56■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 LIG1P18858 919 aa23.56■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.56■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.56■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 CLSTN2Q9H4D0 955 aa23.56■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.56■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.56■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.55■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.55■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 ABCF2Q9UG63 623 aa23.55■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 DACT1Q9NYF0 836 aa23.55■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 IRS2Q9Y4H2 1338 aa23.54■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.54■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.54■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 PRKAB2O43741 272 aa23.54■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 PPARAQ07869 468 aa23.54■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.54■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 RNF214Q8ND24 703 aa23.54■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 KDM4AO75164 1064 aa23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 NT5C2P49902 561 aa23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 BICD2Q8TD16 824 aa23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 USP28Q96RU2 1077 aa23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 YEATS4O95619 227 aa23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 GRAPQ13588 217 aa23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 PPP2R5BQ15173 497 aa23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 TNMDQ9H2S6 317 aa23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.53■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 CTAGE5O15320 804 aa23.52■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 FGRP09769 529 aa23.52■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 NFIXQ14938 502 aa23.52■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 NTRK3Q16288 839 aa23.52■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 FAM182BQ5T319 152 aa23.52■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.52■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.52■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 SMIM5Q71RC9 77 aa23.52■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 ZSCAN30Q86W11 494 aa23.52■■□□□ 1.36
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC69A6NI79 296 aa23.51■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 CAVIN2O95810 425 aa23.51■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 HSPA1LP34931 641 aa23.51■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 CNBD1Q8NA66 436 aa23.51■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.51■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 ERICH2A1L162 156 aa23.51■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.51■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.51■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 WASF1Q92558 559 aa23.51■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.51■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.51■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.5■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 A0A1W2PQ27 194 aa23.5■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 A0A1W2PQ64 194 aa23.5■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 A0A1W2PQD8 194 aa23.5■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 IFNAR1P17181 557 aa23.5■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 ESR2Q92731 530 aa23.5■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 WTAPQ15007 396 aa23.49■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.49■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.49■■□□□ 1.35
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