RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409300.5

RAD9B-204, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD9B, Length 2,732 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD9B-204	ENST00000409300	TGFB2	P61812	414 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	GSTO1	P78417	241 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	STK3	Q13188	491 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	ME3	Q16798	604 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC93	Q567U6	631 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	PODN	Q7Z5L7	613 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	IL27	Q8NEV9	243 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	TOMM22	Q9NS69	142 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	SMIM22	K7EJ46	135 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	ANKRD1	Q15327	319 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	CERS5	Q8N5B7	392 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	NECAB1	Q8N987	351 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	BAG3	O95817	575 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300		B4E1Z4	1266 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	LDHC	P07864	332 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	DDIT3	P35638	169 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	SCNN1D	P51172	638 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	CUL4A	Q13619	759 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	NEDD4	P46934	1319 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	MCM5	P33992	734 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	BTD	P43251	543 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	USP5	P45974	858 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	PPARA	Q07869	468 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	LAMA4	Q16363	1823 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	ZMYM6	O95789	1325 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	USP17L12	C9JPN9	530 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	USP17L21	D6R901	530 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	PRC1	O43663	620 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	PTGER2	P43116	358 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		13.31	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	EVX2	Q03828	476 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	APOBR	Q0VD83	1088 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	PKP1	Q13835	747 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	CTR9	Q6PD62	1173 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	BCS1L	Q9Y276	419 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	SNED1	Q8TER0	1413 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	KDM4A	O75164	1064 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	SLF2	Q8IX21	1173 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	USP17L8	P0C7I0	530 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	ANTXR2	P58335	489 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	USP17L3	A6NCW0	530 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	USP17L4	A6NCW7	530 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	PRDM1	O75626	825 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	YDJC	A8MPS7	323 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	IGSF3	O75054	1194 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	CYP2D6	P10635	497 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	PPP4C	P60510	307 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	ST3GAL1	Q11201	340 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
RAD9B-204	ENST00000409300	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28

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