RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
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ODC1-202ENST00000405333 ZNF213O14771 459 aa23.97■■□□□ 1.43
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ODC1-202ENST00000405333 SCNN1DP51172 638 aa23.97■■□□□ 1.43
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ODC1-202ENST00000405333 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 NAV1Q8NEY1 1877 aa23.88■■□□□ 1.41
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ODC1-202ENST00000405333 MCM2P49736 904 aa23.87■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 TEKT1Q969V4 418 aa23.87■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.87■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 LAMB1P07942 1786 aa23.87■■□□□ 1.41
ODC1-202ENST00000405333 B4E1Z4 1266 aa23.86■■□□□ 1.41
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