RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389757.7

PKP4-201, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP4, Length 5,777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-201ENST00000389757 ANKRD62A6NC57 917 aa11.67□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 SYNMO15061 1565 aa11.67□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 DOK7Q18PE1 504 aa11.67□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 GOPCQ9HD26 462 aa11.67□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 MACROD2A1Z1Q3 448 aa11.67□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 CA8P35219 290 aa11.67□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 CTDSPL2Q05D32 466 aa11.67□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 PTPN14Q15678 1187 aa11.67□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 HS2ST1Q7LGA3 356 aa11.67□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 IMPG2Q9BZV3 1241 aa11.67□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 CSADQ9Y600 493 aa11.67□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 ADCY10Q96PN6 1610 aa11.67□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 NEMFO60524 1076 aa11.67□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 CPA1P15085 419 aa11.67□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa11.67□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 TMC4Q7Z404 712 aa11.67□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 TBC1D5Q92609 795 aa11.67□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.67□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 PLA2R1Q13018 1463 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 GIMAP6Q6P9H5 292 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 CTAGE1Q96RT6 745 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 GREM2Q9H772 168 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 V9GY48 417 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 PPP2R5BQ15173 497 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 LZTS2Q9BRK4 669 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 CENPHQ9H3R5 247 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 ZNF804BA4D1E1 1349 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 XDHP47989 1333 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 CTNNA2P26232 953 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 BCAMP50895 628 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 TFAP4Q01664 338 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 DACT1Q9NYF0 836 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 UBE4AQ14139 1066 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 PROSER3Q2NL68 480 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 DCAF15Q66K64 600 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 ALS2CR12Q96Q35 445 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 AFF2P51816 1311 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 DNA2P51530 1060 aa11.65□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 RILPL1Q5EBL4 403 aa11.65□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 CPXCR1Q8N123 301 aa11.65□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 IQUBQ8NA54 791 aa11.65□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 PIGBQ92521 554 aa11.65□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 PAFAH1B1P43034 410 aa11.65□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 AS3MTQ9HBK9 375 aa11.65□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 KCNQ4P56696 695 aa11.65□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 LEMD3Q9Y2U8 911 aa11.65□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 LRRC24Q50LG9 513 aa11.65□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 UBXN4Q92575 508 aa11.65□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 DSCC1Q9BVC3 393 aa11.65□□□□□ -0.54
PKP4-201ENST00000389757 NOP2P46087 812 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 SNX14Q9Y5W7 946 aa11.65□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 PALLDQ8WX93 1383 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 HEG1Q9ULI3 1381 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 AKR1B10O60218 316 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 TNNT1P13805 278 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 PPARAQ07869 468 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 ZNF174Q15697 407 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 ATL3Q6DD88 541 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 LUZP1Q86V48 1076 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 SYNCQ9H7C4 482 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 NOD1Q9Y239 953 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 BBOX1O75936 387 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 PDE8BO95263 885 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 CASQ1P31415 396 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 SCNN1DP51172 638 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 AKNAD1Q5T1N1 836 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 NSMFQ6X4W1 530 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 ESPNB1AK53 854 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 ERVV-1B6SEH8 477 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 MAP3K9P80192 1104 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 SULF1Q8IWU6 871 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.552e-6■■□□□ 14.1
PKP4-201ENST00000389757 TMCO5BA8MYB1 307 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 USP17L12C9JPN9 530 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 USP17L21D6R901 530 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 ADCY7P51828 1080 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 ZSCAN30Q86W11 494 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 BICDL2A1A5D9 508 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 UBASH3AP57075 661 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 UVSSAQ2YD98 709 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 TAX1BP1Q86VP1 789 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 COPRSQ9NQ92 184 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-201ENST00000389757 VWA3AA6NCI4 1184 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms