RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368210.7

PTPRK-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRK, Length 5,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF445P59923 1031 aa15.03■□□□□ -0
PTPRK-204ENST00000368210 PALD1Q9ULE6 856 aa15.03■□□□□ -0
PTPRK-204ENST00000368210 TAF5LO75529 589 aa15.02■□□□□ -0
PTPRK-204ENST00000368210 ERMNQ8TAM6 284 aa15.02■□□□□ -0
PTPRK-204ENST00000368210 POTEJP0CG39 1038 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 PTGS1P23219 599 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 ASIC1P78348 528 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 CETN1Q12798 172 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 RILPL1Q5EBL4 403 aa15.02□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 AKR1B10O60218 316 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 TRAF1Q13077 416 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 NAA25Q14CX7 972 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 DSCC1Q9BVC3 393 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 STAP2Q9UGK3 403 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 TRAPPC3LQ5T215 181 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 AP1ARQ63HQ0 302 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 NBPF11Q86T75 865 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 ALS2CR12Q96Q35 445 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 ERBB4Q15303 1308 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 A0A0D9SFI3 127 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 PTH1RQ03431 593 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 ANO1Q5XXA6 986 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 RPAINQ86UA6 219 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.011e-9■■□□□ 13.6
PTPRK-204ENST00000368210 IFNKQ9P0W0 207 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 DNAI1Q9UI46 699 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 ELP1O95163 1332 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 MCM7P33993 719 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 IQUBQ8NA54 791 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 DEXIO95424 95 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 GNA11P29992 359 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 PROSER3Q2NL68 480 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 OSBPL3Q9H4L5 887 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 JAK2O60674 1132 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 TBCAO75347 108 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 CDC37L1Q7L3B6 337 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 OTUD6BQ8N6M0 293 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 CNBD1Q8NA66 436 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 MYO1BO43795 1136 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 ME3Q16798 604 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 PPP4R3AQ6IN85 833 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 OGFOD1Q8N543 542 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 SAMM50Q9Y512 469 aa15□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 CETN2P41208 172 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 STX17P56962 302 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 ERO1AQ96HE7 468 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 E7EWF7 191 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 DTHD1Q6ZMT9 781 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 SPATA5Q8NB90 893 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 PRDM1O75626 825 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 ARAP3Q8WWN8 1544 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 MYL5Q02045 173 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 KRT79Q5XKE5 535 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 TAX1BP1Q86VP1 789 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 GTF3C6Q969F1 213 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 COPRSQ9NQ92 184 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 TNNI2P48788 182 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 CLTCL1P53675 1640 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 RIMBP2O15034 1052 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 POTEDQ86YR6 584 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 TTC6Q86TZ1 520 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 SIRT2Q8IXJ6 389 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 TEX11Q8IYF3 940 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 JADE2Q9NQC1 790 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 WDR78Q5VTH9 848 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 WDR66Q8TBY9 1149 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 TMEM94Q12767 1356 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 NOP2P46087 812 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 MCM6Q14566 821 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 SPAG5Q96R06 1193 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-204ENST00000368210 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms