RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SMC4Q9NTJ3 1288 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RGS12O14924 1447 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IL16Q14005 1332 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CRB1P82279 1406 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PHKG2P15735 406 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AMPD3Q01432 767 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MSS51Q4VC12 460 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TAF7LQ5H9L4 462 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BRINP2Q9C0B6 783 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MEGF6O75095 1541 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GDF10P55107 478 aa7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RRP1P56182 461 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CABP4P57796 275 aa7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC39A6Q13433 755 aa7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C8orf58Q8NAV2 365 aa7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPRASP2Q96D09 838 aa7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CSRNP1Q96S65 589 aa7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IRS1P35568 1242 aa7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BCAMP50895 628 aa7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DDB1Q16531 1140 aa7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BAP1Q92560 729 aa7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP3Q9Y6I4 520 aa7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RGPD1P0DJD0 1748 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BRWD3Q6RI45 1802 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CHL1O00533 1208 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNQ3O43525 872 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RARSP54136 660 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AGERQ15109 404 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VPS37DQ86XT2 251 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NBPF3Q9H094 633 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COL18A1P39060 1754 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLCH1Q4KWH8 1693 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EDEM1Q92611 657 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 F6X3S4 739 aa7.97□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF853P0CG23 659 aa7.97□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ETFBP38117 255 aa7.97□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC181Q5TID7 509 aa7.97□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.97□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TTC5Q8N0Z6 440 aa7.97□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SSH1Q8WYL5 1049 aa7.97□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DCAF5Q96JK2 942 aa7.97□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa7.97□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa7.97□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DLG5Q8TDM6 1919 aa7.97□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDGFAP04085 211 aa7.97□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C20orf194Q5TEA3 1177 aa7.97□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPSB2Q99619 263 aa7.97□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.97□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GLI3P10071 1580 aa7.96□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa7.96□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa7.96□□□□□ -1.13
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VAMP4O75379 141 aa7.96□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FBF1Q8TES7 1133 aa7.96□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRCH3Q96II8 777 aa7.96□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.96□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SNTG2Q9NY99 539 aa7.96□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC85CA6NKD9 419 aa7.95□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNAJC6O75061 913 aa7.95□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GORABQ5T7V8 394 aa7.95□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.95□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.95□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPC25Q9HBM1 224 aa7.95□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.95□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.95□□□□□ -1.14
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