RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 KDRP35968 1356 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 CASP1P29466 404 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 KIF6Q6ZMV9 814 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 TTLL7Q6ZT98 887 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 OSBP2Q969R2 916 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 PSMB7Q99436 277 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 HAUS7Q99871 368 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 ZMYND10O75800 440 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 SARM1Q6SZW1 724 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 HELLSQ9NRZ9 838 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 RTEL1Q9NZ71 1219 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 AKAP2Q9Y2D5 859 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 M0R2C6 588 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 HOXB7P09629 217 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 IFNL2Q8IZJ0 200 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 SLF1Q9BQI6 1058 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 MAST3O60307 1309 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 CTDSPL2Q05D32 466 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 SYCP1Q15431 976 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 XAGE2Q96GT9 111 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 MPHOSPH8Q99549 860 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 YEATS4O95619 227 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 CCDC181Q5TID7 509 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 WDR24Q96S15 920 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 NACAP1Q9BZK3 213 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 EYA2O00167 538 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 MICALL1Q8N3F8 863 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 CCDC148Q8NFR7 591 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 SOWAHDA6NJG2 315 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 MTF1Q14872 753 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 ALKQ9UM73 1620 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF174Q15697 407 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 KRT28Q7Z3Y7 464 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 BLZF1Q9H2G9 400 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 EFCAB8A8MWE9 144 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 LONRF2Q1L5Z9 754 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 ATL3Q6DD88 541 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 TRIM66O15016 1216 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 CTDNEP1O95476 244 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 CMA1P23946 247 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 RTN1Q16799 776 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 MFSD6Q6ZSS7 791 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 RGS22Q8NE09 1264 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 TANGO6Q9C0B7 1094 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 BABAM1Q9NWV8 329 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 SETQ01105 290 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 POSTNQ15063 836 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 NYAP1Q6ZVC0 841 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 MLH3Q9UHC1 1453 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 VWA3AA6NCI4 1184 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 ENC1O14682 589 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 PRDM1O75626 825 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 TAB2Q9NYJ8 693 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 KIF28PB7ZC32 967 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 WTAPQ15007 396 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 GBP3Q9H0R5 595 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 WASF1Q92558 559 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 DSCC1Q9BVC3 393 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRN-201ENST00000295718 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.22
PTPRN-201ENST00000295718 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.22
PTPRN-201ENST00000295718 HDXQ7Z353 690 aa16.46■□□□□ 0.22
PTPRN-201ENST00000295718 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.22
PTPRN-201ENST00000295718 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.22
PTPRN-201ENST00000295718 COPRSQ9NQ92 184 aa16.46■□□□□ 0.22
PTPRN-201ENST00000295718 FAN1Q9Y2M0 1017 aa16.46■□□□□ 0.22
PTPRN-201ENST00000295718 ATF3P18847 181 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRN-201ENST00000295718 TXLNAP40222 546 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRN-201ENST00000295718 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
PTPRN-201ENST00000295718 PRDM11Q9NQV5 511 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRN-201ENST00000295718 CTNND2Q9UQB3 1225 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRN-201ENST00000295718 FAM170AA1A519 330 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRN-201ENST00000295718 MACROD2A1Z1Q3 448 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRN-201ENST00000295718 KAZALD1Q96I82 304 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRN-201ENST00000295718 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
PTPRN-201ENST00000295718 CEP131Q9UPN4 1083 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRN-201ENST00000295718 NR5A1Q13285 461 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRN-201ENST00000295718 CEP112Q8N8E3 955 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRN-201ENST00000295718 ACRBPQ8NEB7 543 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRN-201ENST00000295718 UBXN1Q04323 297 aa16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms