RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266079.4

PRPF6-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF6, Length 3,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6-201ENST00000266079 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 SGSM2O43147 1006 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 IGSF3O75054 1194 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 TMC4Q7Z404 712 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 PALD1Q9ULE6 856 aa14.82□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 F8W031 263 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 GTF2IP78347 998 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 PTH1RQ03431 593 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 GRIK5Q16478 980 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 OSBP2Q969R2 916 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.81□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.8□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 TGFB2P61812 414 aa14.8□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.8□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.8□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.8□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 M0R2C6 588 aa14.8□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 PPIP5K2O43314 1243 aa14.8□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 UBE2HP62256 183 aa14.8□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 PLCB2Q00722 1185 aa14.8□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 VPS53Q5VIR6 699 aa14.8□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 AP5Z1O43299 807 aa14.79□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 PDE6AP16499 860 aa14.79□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 SYCP1Q15431 976 aa14.79□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 RUFY2Q8WXA3 655 aa14.79□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.79□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 MAP3K12Q12852 859 aa14.79□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 CCDC93Q567U6 631 aa14.79□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 IL17RAQ96F46 866 aa14.79□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.046e-7■■■□□ 16
PRPF6-201ENST00000266079 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.79□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 A0A1B0GUL6 1792 aa14.79□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 TMEM51Q9NW97 253 aa14.79□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 MAST3O60307 1309 aa14.78□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 ADGRA1Q86SQ6 560 aa14.78□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.78□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 HIP1O00291 1037 aa14.78□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 CYP7A1P22680 504 aa14.78□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.78□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.78□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 ADD2P35612 726 aa14.77□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.77□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.77□□□□□ -0.04
PRPF6-201ENST00000266079 MED23Q9ULK4 1368 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 EYA3Q99504 573 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.77□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 SPC24Q8NBT2 197 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 ZNF384Q8TF68 577 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 ARMT1Q9H993 441 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 ECE2O60344 883 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 APPP05067 770 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 RASSF7Q02833 373 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 MECOMQ03112 1051 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 GIMAP6Q6P9H5 292 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.76□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 GPAA1O43292 621 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 RAD17O75943 681 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 MBD4O95243 580 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 APPBP2Q92624 585 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 AIDAQ96BJ3 306 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 SYT17Q9BSW7 474 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 COA1Q9GZY4 146 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 CCDC171Q6TFL3 1326 aa14.75□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 SMTNL1A8MU46 457 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 PRKAB2O43741 272 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 IL1R1P14778 569 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 SCNN1DP51172 638 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 PDE4CQ08493 712 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.74□□□□□ -0.05
PRPF6-201ENST00000266079 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 57.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms