RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262903.8

HACE1-201, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HACE1, Length 4,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-201ENST00000262903 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
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HACE1-201ENST00000262903 EHMT1Q9H9B1 1298 aa18.18■□□□□ 0.5
HACE1-201ENST00000262903 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa18.18■□□□□ 0.5
HACE1-201ENST00000262903 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
HACE1-201ENST00000262903 PTPN14Q15678 1187 aa18.18■□□□□ 0.5
HACE1-201ENST00000262903 SYNE4Q8N205 404 aa18.18■□□□□ 0.5
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HACE1-201ENST00000262903 DEXIO95424 95 aa18.18■□□□□ 0.5
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HACE1-201ENST00000262903 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
HACE1-201ENST00000262903 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
HACE1-201ENST00000262903 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 30.7
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HACE1-201ENST00000262903 SUSD4Q5VX71 490 aa18.17■□□□□ 0.5
HACE1-201ENST00000262903 RRAGBQ5VZM2 374 aa18.17■□□□□ 0.5
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HACE1-201ENST00000262903 TTLL11Q8NHH1 800 aa18.17■□□□□ 0.5
HACE1-201ENST00000262903 GPCPD1Q9NPB8 672 aa18.17■□□□□ 0.5
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HACE1-201ENST00000262903 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
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HACE1-201ENST00000262903 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
HACE1-201ENST00000262903 PI4K2BQ8TCG2 481 aa18.16■□□□□ 0.5
HACE1-201ENST00000262903 GTF3C6Q969F1 213 aa18.16■□□□□ 0.5
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HACE1-201ENST00000262903 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa18.16■□□□□ 0.5
HACE1-201ENST00000262903 TEX35Q5T0J7 233 aa18.16■□□□□ 0.5
HACE1-201ENST00000262903 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
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HACE1-201ENST00000262903 UBE4AQ14139 1066 aa18.15■□□□□ 0.5
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HACE1-201ENST00000262903 SEPT12Q8IYM1 358 aa18.15■□□□□ 0.5
HACE1-201ENST00000262903 LARGE2Q8N3Y3 721 aa18.15■□□□□ 0.5
HACE1-201ENST00000262903 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa18.15■□□□□ 0.5
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HACE1-201ENST00000262903 N4BP3O15049 544 aa18.15■□□□□ 0.5
HACE1-201ENST00000262903 ALDH1B1P30837 517 aa18.15■□□□□ 0.5
HACE1-201ENST00000262903 UBASH3AP57075 661 aa18.15■□□□□ 0.5
HACE1-201ENST00000262903 HSP90B2PQ58FF3 399 aa18.15■□□□□ 0.5
HACE1-201ENST00000262903 PLIN2Q99541 437 aa18.15■□□□□ 0.5
HACE1-201ENST00000262903 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa18.14■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 WWC2Q6AWC2 1192 aa18.14■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 ZNF804BA4D1E1 1349 aa18.14■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 CRB1P82279 1406 aa18.14■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 NBPF26B4DH59 902 aa18.14■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 UBE3CQ15386 1083 aa18.14■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 RILPL1Q5EBL4 403 aa18.14■□□□□ 0.49
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HACE1-201ENST00000262903 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
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HACE1-201ENST00000262903 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa18.14■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 KCNJ14Q9UNX9 436 aa18.14■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 PREX1Q8TCU6 1659 aa18.14■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 VWA3AA6NCI4 1184 aa18.14■□□□□ 0.49
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HACE1-201ENST00000262903 EXOC1Q9NV70 894 aa18.14■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 SNAP23O00161 211 aa18.13■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 MTX1Q13505 466 aa18.13■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 CCDC40Q4G0X9 1142 aa18.13■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 TMEM63CQ9P1W3 806 aa18.13■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 MAST3O60307 1309 aa18.13■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 GSDMDP57764 484 aa18.13■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 ASIC1P78348 528 aa18.13■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 LETM2Q2VYF4 491 aa18.13■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 ZSCAN12O43309 604 aa18.13■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 FAM160A1Q05DH4 1040 aa18.13■□□□□ 0.49
HACE1-201ENST00000262903 TRAF1Q13077 416 aa18.13■□□□□ 0.49
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