RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-201ENST00000261266 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRB-201ENST00000261266 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-201ENST00000261266 EPB41P11171 864 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-201ENST00000261266 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-201ENST00000261266 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-201ENST00000261266 SAMM50Q9Y512 469 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRB-201ENST00000261266 ALDH3A1P30838 453 aa10.18□□□□□ -0.78
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PTPRB-201ENST00000261266 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP10.18□□□□□ -0.78
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PTPRB-201ENST00000261266 TMOD4Q9NZQ9 345 aa10.17□□□□□ -0.78
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PTPRB-201ENST00000261266 hCG_1984214I3L0E3 225 aa10.17□□□□□ -0.78
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PTPRB-201ENST00000261266 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
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PTPRB-201ENST00000261266 ERO1AQ96HE7 468 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRB-201ENST00000261266 TRIM35Q9UPQ4 493 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRB-201ENST00000261266 UGGT1Q9NYU2 1555 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRB-201ENST00000261266 DDAH1O94760 285 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRB-201ENST00000261266 GOLGA5Q8TBA6 731 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC113Q9H0I3 377 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRB-201ENST00000261266 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
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