RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 USP40Q9NVE5 1235 aa27.19■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 DOCK2Q92608 1830 aa27.19■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 RHBDL3P58872 404 aa27.18■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 NFIAQ12857 509 aa27.18■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 ADGRA1Q86SQ6 560 aa27.18■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 SLF2Q8IX21 1173 aa27.18■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 TMEM39BQ9GZU3 492 aa27.18■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 IGSF3O75054 1194 aa27.17■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 BTDP43251 543 aa27.17■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 TNFAIP1Q13829 316 aa27.17■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 FAM83AQ86UY5 434 aa27.17■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 C2orf69Q8N8R5 385 aa27.17■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 HHIPL1Q96JK4 782 aa27.17■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 FAM198AQ9UFP1 575 aa27.17■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 SALL3Q9BXA9 1300 aa27.17■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 LDHCP07864 332 aa27.16■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 VEGFBP49765 207 aa27.16■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 GSTO1P78417 241 aa27.16■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD45Q5TZF3 282 aa27.16■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 HAUS7Q99871 368 aa27.16■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 ECHDC1Q9NTX5 307 aa27.16■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 FZD1Q9UP38 647 aa27.16■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 RFX7Q2KHR2 1363 aa27.16■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 FKBP1BP68106 108 aa27.16■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 TSHZ3Q63HK5 1081 aa27.16■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 MAST2Q6P0Q8 1798 aa27.15■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa27.15■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 HUNKP57058 714 aa27.15■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 ZFPM1Q8IX07 1006 aa27.15■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 JMYQ8N9B5 988 aa27.15■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 IDI2Q9BXS1 227 aa27.15■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 TMOD2Q9NZR1 351 aa27.15■■□□□ 1.94
SYF2-201ENST00000236273 GOLIM4O00461 696 aa27.14■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 IDH1O75874 414 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 TNNI2P48788 182 aa27.14■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 CYP4F22Q6NT55 531 aa27.14■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 UBE2Q2LH0YL09 131 aa27.13■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 PPP4CP60510 307 aa27.13■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa27.13■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 FAM151AQ8WW52 585 aa27.13■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 PRKG1Q13976 671 aa27.12■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 MAP3K11Q16584 847 aa27.12■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 PAG1Q9NWQ8 432 aa27.12■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 USP2O75604 605 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 NF2P35240 595 aa27.11■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 LDLRAD1Q5T700 205 aa27.11■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 MAGEB6Q8N7X4 407 aa27.11■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 PI4K2BQ8TCG2 481 aa27.11■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 CAPNS2Q96L46 248 aa27.11■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 CYP7A1P22680 504 aa27.1■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 RGS3P49796 1198 aa27.1■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 TCP10Q12799 353 aa27.1■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 MAP3K12Q12852 859 aa27.1■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa27.09■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.09■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 RGMBQ6NW40 437 aa27.09■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa27.09■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 TTC41PQ6P2S7 1318 aa27.08■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 ENTPD3O75355 529 aa27.08■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 PDE6AP16499 860 aa27.08■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 NUCB1Q02818 461 aa27.08■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
SYF2-201ENST00000236273 NPM3O75607 178 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 CHGBP05060 677 aa27.07■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 MX1P20591 662 aa27.07■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 SLFNL1Q499Z3 407 aa27.07■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa27.07■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 ARMC9Q7Z3E5 817 aa27.07■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 LNPKQ9C0E8 428 aa27.07■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 STAP2Q9UGK3 403 aa27.07■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 GPATCH3Q96I76 525 aa27.06■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 ZIC5Q96T25 663 aa27.06■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa27.06■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 AOC2O75106 756 aa27.05■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 BAG3O95817 575 aa27.05■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 CHD1LQ86WJ1 897 aa27.05■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 MIGA1Q8NAN2 632 aa27.05■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 ADD2P35612 726 aa27.04■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 ECE1P42892 770 aa27.04■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 PICALMQ13492 652 aa27.04■■□□□ 1.92
SYF2-201ENST00000236273 TEX11Q8IYF3 940 aa27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms