RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS37DQ86XT2 251 aa25.57■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 MYL5Q02045 173 aa25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 TRDNQ13061 729 aa25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 MAP3K14Q99558 947 aa25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.682e-8■■■■■ 28.6
HTATSF1-201ENST00000218364 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 ATRNO75882 1429 aa25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 TNS2Q63HR2 1409 aa25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 ETF1P62495 437 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT40Q6A162 431 aa25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 RESP18Q5W5W9 173 aa25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 AIFM3Q96NN9 605 aa25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 ADD2P35612 726 aa25.55■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF446Q9NWS9 450 aa25.55■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 TERF2Q15554 542 aa25.55■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 PI16Q6UXB8 463 aa25.55■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 CYB5R4Q7L1T6 521 aa25.55■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 UBASH3AP57075 661 aa25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 MYH7P12883 1935 aa25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 ISM2Q6H9L7 571 aa25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 TBC1D10CQ8IV04 446 aa25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 DPF2Q92785 391 aa25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 MCAMP43121 646 aa25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 APOA5Q6Q788 366 aa25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 VSTM4Q8IW00 320 aa25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 CUTAO60888 179 aa25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 CDC27P30260 824 aa25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM65Q6PJ69 517 aa25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 BRINP3Q76B58 766 aa25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRN4CLQ8ND94 238 aa25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM87BQ96K49 555 aa25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1-201ENST00000218364 PNOCQ13519 176 aa25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 NTRK3Q16288 839 aa25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 SERPINC1P01008 464 aa25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 HOMER1Q86YM7 354 aa25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
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HTATSF1-201ENST00000218364 FAM193AP78312 1265 aa25.5■■□□□ 1.67
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HTATSF1-201ENST00000218364 UBE3CQ15386 1083 aa25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 KRBA2Q6ZNG9 492 aa25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 OLFM4Q6UX06 510 aa25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 REXO1L1PQ8IX06 675 aa25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 CFAP100Q494V2 611 aa25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC102BQ68D86 513 aa25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 SGMS1Q86VZ5 419 aa25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM89AQ96GI7 184 aa25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAI1Q9UI46 699 aa25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 PHKBQ93100 1093 aa25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 CLIC6Q96NY7 704 aa25.49■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 LONRF3Q496Y0 759 aa25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 STK36Q9NRP7 1315 aa25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 NPHP1O15259 732 aa25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 ZBTB43O43298 467 aa25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 METTL24Q5JXM2 366 aa25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 SENP2Q9HC62 589 aa25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNH3Q9ULD8 1083 aa25.48■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 TOP1P11387 765 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 TAF3Q5VWG9 929 aa25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM139Q8IV31 216 aa25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 FANCLQ9NW38 375 aa25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 RXRAP19793 462 aa25.47■■□□□ 1.67
HTATSF1-201ENST00000218364 CLCN6P51797 869 aa25.47■■□□□ 1.67
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