RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 FIBPO43427 364 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 GOLGA8BA8MQT2 603 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 MRE11P49959 708 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 MECOMQ03112 1051 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 GPSM2P81274 684 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM87BQ96K49 555 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 KIF3AQ9Y496 699 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 H3BQV1 296 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 RXRBP28702 533 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 IFFO2Q5TF58 517 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 PRDX5P30044 214 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 RESTQ13127 1097 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 KRT23Q9C075 422 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 NRXN2Q9P2S2 1712 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 KDM4AO75164 1064 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 BBOX1O75936 387 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 UBE2HP62256 183 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 KRT85P78386 507 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 PPARAQ07869 468 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 LY9Q9HBG7 655 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 SENP2Q9HC62 589 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 JAG2Q9Y219 1238 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.22■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.21■□□□□ 0.83
RABGGTA-201ENST00000216840 PPFIA3O75145 1194 aa20.21■□□□□ 0.83
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RABGGTA-201ENST00000216840 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
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RABGGTA-201ENST00000216840 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 UFL1O94874 794 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 LIFRP42702 1097 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 APOA5Q6Q788 366 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 TTC6Q86TZ1 520 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 GGA1Q9UJY5 639 aa20.2■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 LTBP1Q14766 1721 aa20.19■□□□□ 0.82
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RABGGTA-201ENST00000216840 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.19■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 ELP1O95163 1332 aa20.19■□□□□ 0.82
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RABGGTA-201ENST00000216840 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.18■□□□□ 0.82
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RABGGTA-201ENST00000216840 SYCE3A1L190 88 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 CPLX1O14810 134 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 IGSF3O75054 1194 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
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RABGGTA-201ENST00000216840 PANK2Q9BZ23 570 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 TOMM22Q9NS69 142 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 LAMB1P07942 1786 aa20.18■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 SMIM22K7EJ46 135 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 MTA3Q9BTC8 594 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-201ENST00000216840 ZBTB43O43298 467 aa20.17■□□□□ 0.82
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