RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.12■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 BPIFA3Q9BQP9 254 aa20.12■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 LY9Q9HBG7 655 aa20.12■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.12■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.12■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 SENP2Q9HC62 589 aa20.12■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 ZBTB43O43298 467 aa20.11■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 PARP10Q53GL7 1025 aa20.11■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.11■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 RTL9Q8NET4 1388 aa20.11■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.11■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 NEMFO60524 1076 aa20.11■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF202O95125 648 aa20.11■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 KRT40Q6A162 431 aa20.11■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 AIFM3Q96NN9 605 aa20.11■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 MBD4O95243 580 aa20.1■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 VPS37DQ86XT2 251 aa20.1■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 NAPBQ9H115 298 aa20.1■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.1■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.1■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 A0A087WWV3 80 aa20.1■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.1■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 PPP6R2O75170 966 aa20.1■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 CAMTA2O94983 1202 aa20.1■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM67Q5HYA8 995 aa20.1■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 TIGD1Q96MW7 591 aa20.1■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.1■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 NID2Q14112 1375 aa20.09■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.09■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.09■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 MICU3Q86XE3 530 aa20.09■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 LRRC8AQ8IWT6 810 aa20.09■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.09■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.09■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 STK36Q9NRP7 1315 aa20.09■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 SNAP23O00161 211 aa20.08■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 PFKFB1P16118 471 aa20.08■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 GNAT2P19087 354 aa20.08■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 RXRAP19793 462 aa20.08■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 PTPAQ15257 358 aa20.08■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 PHKBQ93100 1093 aa20.08■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 KRT23Q9C075 422 aa20.08■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.08■□□□□ 0.81
CLDN11-201ENST00000064724 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.08■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 GOLGA8AA7E2F4 631 aa20.08■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.08■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 ARMT1Q9H993 441 aa20.08■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 INCENPQ9NQS7 918 aa20.08■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 DPCR1Q3MIW9 517 aa20.07■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.07■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 MAP3K14Q99558 947 aa20.07■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 MTA3Q9BTC8 594 aa20.07■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 HPSEQ9Y251 543 aa20.07■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.07■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 DOCK2Q92608 1830 aa20.07■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 NTSR2O95665 410 aa20.07■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.07■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 JMYQ8N9B5 988 aa20.07■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.07■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 ATP6V1AP38606 617 aa20.06■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 BCAMP50895 628 aa20.06■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 NLRP12P59046 1061 aa20.06■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.06■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 NACAP1Q9BZK3 213 aa20.06■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 TIAM2Q8IVF5 1701 aa20.06■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 DOT1LQ8TEK3 1739 aa20.06■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 WNK3Q9BYP7 1800 aa20.06■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.05■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 IFNAR1P17181 557 aa20.05■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 SIK1P57059 783 aa20.05■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa20.05■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 TRIM29Q14134 588 aa20.05■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 DDB1Q16531 1140 aa20.05■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
CLDN11-201ENST00000064724 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms