RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000124246.3

Gt(ROSA)26Sor-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gt(ROSA)26Sor, Length 1,181 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 RabggtaQ9JHK4 567 aa26.02■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cd2apQ9JLQ0 637 aa26.02■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Plxnb2B2RXS4 1842 aa26.02■■□□□ 1.76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Triml2E9PW10 424 aa26.01■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Oog1E9Q5G7 496 aa26.01■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Znf692Q3U381 531 aa26.01■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cdcp1Q5U462 833 aa26.01■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 GorabQ8BRM2 368 aa26.01■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 4930504O13RikQ8C5Z9 145 aa26.01■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Taf5lQ91WQ5 589 aa26.01■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rfc4Q99J62 364 aa26.01■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rgs12Q8CGE9 1381 aa26■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Plekhg2Q6KAU7 1340 aa26■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Asap2Q7SIG6 958 aa26■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Srgap3Q812A2 1099 aa26■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Atrnl1Q6A051 1378 aa25.99■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Zc3h4Q6ZPZ3 1304 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Col20a1Q923P0 1320 aa25.99■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm43951A0A0N4SUT6 962 aa25.99■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gba2Q69ZF3 918 aa25.99■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fam155aQ8CCS2 467 aa25.99■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gpr37l1Q99JG2 481 aa25.99■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa25.98■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Atxn7Q8R4I1 867 aa25.98■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mei1Q9D4I2 1268 aa25.98■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Sept14Q9DA97 430 aa25.98■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tbc1d8bA3KGB4 1114 aa25.97■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pagr1bF6V0H0 108 aa25.97■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Slc27a3O88561 667 aa25.97■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cfap69Q8BH53 942 aa25.97■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Riok1Q922Q2 567 aa25.97■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pagr1aQ99L02 253 aa25.97■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Syt5Q9R0N5 386 aa25.97■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 NesQ6P5H2 1864 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cyp2b10P12791 500 aa25.96■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Prl3d1P18121 224 aa25.96■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gjb1P28230 283 aa25.96■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Amer2Q8CCJ4 672 aa25.96■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Phf20l1Q8CCJ9 1013 aa25.96■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Yipf1Q91VU1 306 aa25.96■■□□□ 1.75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rfpl4bJ3QPR6 266 aa25.95■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ccnd3P30282 292 aa25.95■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tbc1d9bQ5SVR0 1263 aa25.95■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Usp33Q8R5K2 909 aa25.95■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Wdr70Q3TWF6 657 aa25.94■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ces5aQ6AW46 575 aa25.94■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Map10Q8BJS7 891 aa25.94■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Zbed3Q9D0L1 228 aa25.94■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Epb41l3Q9WV92 929 aa25.94■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mroh6V9GX81 722 aa25.94■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Abcc4E9Q236 1325 aa25.93■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm13128L7MU96 475 aa25.93■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 ArxO35085 564 aa25.93■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Eps15P42567 897 aa25.93■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Eif5P59325 429 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 PaoxQ8C0L6 504 aa25.93■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 CsadQ9DBE0 493 aa25.93■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mctp2Q5RJH2 878 aa25.92■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rbm6S4R1W5 1118 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ep400Q8CHI8 3072 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm15262A0A140LIQ5 728 aa25.91■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Stxbp2Q64324 593 aa25.91■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Myh14Q6URW6 2000 aa25.9■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1700003F12RikA2AKE5 210 aa25.9■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Arl14Q3SXC5 192 aa25.9■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Zfp953Q3UPV7 304 aa25.9■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Krt40Q6IFX3 439 aa25.9■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tmem266Q8BZB3 538 aa25.9■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pank1Q8K4K6 548 aa25.9■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Snapc2Q91XA5 359 aa25.9■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm44503E9PYU5 387 aa25.89■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fads2p1Q0VAX3 487 aa25.89■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Klhdc9Q3USL1 350 aa25.89■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fam160b2Q80YR2 744 aa25.89■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dnaaf4Q8R368 420 aa25.89■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Xrcc4Q924T3 326 aa25.89■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 GrapQ9CX99 217 aa25.89■■□□□ 1.74
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Siah1aP61092 282 aa25.88■■□□□ 1.73
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 B230104I21RikQ3USW4 141 aa25.88■■□□□ 1.73
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Garem2Q6PAJ3 880 aa25.88■■□□□ 1.73
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Slc9c1Q6UJY2 1175 aa25.88■■□□□ 1.73
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dclk1Q9JLM8 756 aa25.88■■□□□ 1.73
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Myh2G3UW82 1942 aa25.88■■□□□ 1.73
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 DbnlQ62418 436 aa25.87■■□□□ 1.73
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Senp6Q6P7W0 1132 aa25.87■■□□□ 1.73
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Nme8Q715T0 586 aa25.87■■□□□ 1.73
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Palm3A2TJV2 734 aa25.86■■□□□ 1.73
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pdlim7Q3TJD7 457 aa25.86■■□□□ 1.73
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Olfm4Q3UZZ4 505 aa25.86■■□□□ 1.73
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Lrch3Q8BVU0 778 aa25.86■■□□□ 1.73
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rnf208Q8K0W3 265 aa25.86■■□□□ 1.73
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1700018B08RikQ9DA83 213 aa25.86■■□□□ 1.73
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fam205a1D3YZF6 1314 aa25.86■■□□□ 1.73
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Adgra3Q7TT36 1310 aa25.86■■□□□ 1.73
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Sbf1Q6ZPE2 1867 aa25.85■■□□□ 1.73
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ces1aE9PYP1 563 aa25.85■■□□□ 1.73
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tnni2P13412 182 aa25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.2 ms