RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059794.3

Nhlh1-201, Transcript of Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nhlh1, Length 2,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Map3k12Q60700 888 aa22.34■■□□□ 1.17
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Sgsm2Q80U12 1005 aa22.34■■□□□ 1.17
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Podxl2Q8CAE9 603 aa22.34■■□□□ 1.17
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Txnrd3Q99MD6 652 aa22.34■■□□□ 1.17
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Pla2g12bQ99P27 195 aa22.34■■□□□ 1.17
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Slx4ipQ9D7Y9 413 aa22.34■■□□□ 1.17
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Anapc15P60007 132 aa22.33■■□□□ 1.17
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Tm4sf1Q64302 202 aa22.33■■□□□ 1.17
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Adck5Q80V03 582 aa22.33■■□□□ 1.17
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Ptrh1Q8BW00 204 aa22.33■■□□□ 1.17
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa22.33■■□□□ 1.17
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 NapbP28663 298 aa22.33■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Agtpbp1Q641K1 1218 aa22.33■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Eaf2Q91ZD6 262 aa22.33■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Spryd3E9Q9B3 442 aa22.32■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Rnf20Q5DTM8 973 aa22.32■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Myl6bQ8CI43 207 aa22.32■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Kcnb2A6H8H5 907 aa22.32■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Esyt2Q3TZZ7 845 aa22.32■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Gse1Q3U3C9 1213 aa22.32■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa22.32■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Atf7Q8R0S1 413 aa22.32■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Grem2O88273 168 aa22.31■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Gjb2Q00977 226 aa22.31■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 HelbQ6NVF4 1074 aa22.31■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 MlphQ91V27 590 aa22.31■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Aox3G3X982 1335 aa22.31■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Hap1O35668 628 aa22.31■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Sp8Q8BMJ8 486 aa22.31■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 RabggtaQ9JHK4 567 aa22.3■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Col5a2Q3U962 1497 aa22.3■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Pnpla6Q3TRM4 1355 aa22.3■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Il4rP16382 810 aa22.3■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Spata18Q0P557 537 aa22.3■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 CrkQ64010 304 aa22.3■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Gm2163Q6PCY5 473 aa22.3■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 SpidrQ8BGX7 933 aa22.3■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Irgm2A0A140LIF8 407 aa22.29■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Abl1P00520 1123 aa22.29■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 CfhP06909 1234 aa22.29■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Gnat2P50149 354 aa22.29■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Psmd1Q3TXS7 953 aa22.29■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 SnrkQ8VDU5 748 aa22.29■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa22.29■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Tbc1d2bQ3U0J8 965 aa22.29■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Spata5Q3UMC0 893 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Efcc1Q9JJF6 558 aa22.29■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Hmg20bQ9Z104 317 aa22.29■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Psme4Q5SSW2 1843 aa22.29■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Cacnb3P54285 484 aa22.28■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Ppp4cP97470 307 aa22.28■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Rpusd2Q149F1 553 aa22.28■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Map3k9Q3U1V8 1077 aa22.28■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Tti2Q8BGV4 512 aa22.28■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Cnot6lQ8VEG6 555 aa22.28■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Dennd3A2RT67 1274 aa22.28■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Cyp2d34L7N463 504 aa22.28■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 EvcP57680 1005 aa22.28■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Zhx1P70121 873 aa22.28■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Map9Q3TRR0 646 aa22.28■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Rsph3aQ3UFY4 516 aa22.28■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Tbc1d23Q8K0F1 684 aa22.28■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Nfe2l3Q9WTM4 660 aa22.28■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Myh2G3UW82 1942 aa22.27■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa22.27■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Mboat7Q8CHK3 473 aa22.27■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa22.27■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Ecm29Q6PDI5 1840 aa22.27■■□□□ 1.16
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Pkp1P97350 728 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Ctr9Q62018 1173 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Pramel6Q810Y9 485 aa22.26■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa22.26■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Cyp27a1Q9DBG1 533 aa22.26■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Gas1Q01721 343 aa22.26■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Slc10a5Q5PT54 434 aa22.26■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Ttc12Q8BW49 704 aa22.26■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Glt1d1A4FUP9 346 aa22.25■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Adam7O35227 789 aa22.25■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Otop3Q80UF9 577 aa22.25■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Rai14Q9EP71 979 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Sil1Q9EPK6 465 aa22.25■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Tnni2P13412 182 aa22.25■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 D1Pas1P16381 660 aa22.25■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Mical3Q8CJ19 1993 aa22.25■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Rfx1P48377 963 aa22.24■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 ImmtQ8CAQ8 757 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Mrpl50Q8VDT9 159 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Q9D9S1 216 aa22.24■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Rbm6S4R1W5 1118 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Tsc2Q61037 1814 aa22.23■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Ccdc93Q7TQK5 629 aa22.23■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Olfr118Q7TRJ6 321 aa22.23■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Tmem79Q9D709 391 aa22.23■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Myh6Q02566 1938 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Pde11aP0C1Q2 933 aa22.22■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Usp48Q3V0C5 1052 aa22.22■■□□□ 1.15
Nhlh1-201ENSMUST00000059794 Ehmt1Q5DW34 1296 aa22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.7 ms