RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		3.61	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5H1	A6NKK0	313 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CNIH1	O95406	144 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	MOS	P00540	346 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV3-15	P01624	115 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CD99	P14209	185 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	PIGP	P57054	158 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	FGF12	P61328	243 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	C6orf99	Q4VX62	202 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	MDP1	Q86V88	176 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	NIT1	Q86X76	327 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	DCUN1D4	Q92564	292 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	FMC1	Q96HJ9	113 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CYYR1	Q96J86	154 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10C1	Q96KK4	312 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		3.6	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A0J9YXY3	114 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	DEGS1	O15121	323 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	PSPHP1	O15172	72 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CD5	P06127	495 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SSTR5	P35346	364 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM33	P57088	247 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SYNJ2BP	P57105	145 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	FXYD4	P59646	89 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	GNG3	P63215	75 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	IL15RA	Q13261	267 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SMCO1	Q147U7	214 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	MPV17L	Q2QL34	196 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SP6	Q3SY56	376 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2T2	Q6IF00	324 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616		Q6ZS49	121 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00596	Q86U02	117 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	OR1S1	Q8NH92	325 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	MUCL1	Q96DR8	90 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	REG4	Q9BYZ8	158 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	NAA60	Q9H7X0	242 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	RASL12	Q9NYN1	266 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	RTTN	Q86VV8	2226 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	HCFC1	P51610	2035 aa		3.59	□□□□□ -1.83
EFHC1-223	ENST00000636616	C8orf87	E5RJ46	101 aa		3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	CRYZL1	O95825	349 aa		3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	NAPSA	O96009	420 aa		3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	CBR1	P16152	277 aa		3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	CTRL	P40313	264 aa		3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PPOX	P50336	477 aa		3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	S100A10	P60903	97 aa		3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PMVK	Q15126	192 aa		3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	C1orf195	Q5TG92	126 aa		3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	BAP18	Q8IXM2	172 aa		3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	MUC15	Q8N387	334 aa		3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	OR1P1	Q8NH06	330 aa		3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	CCL17	Q92583	94 aa		3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	AQP10	Q96PS8	301 aa		3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	OR51I2	Q9H344	312 aa		3.59	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	APC	P25054	2843 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A087WYN8	130 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PPR1	153 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616		K7EPK0	472 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	BET1	O15155	118 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SERF1A	O75920	110 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	LYZL6	O75951	148 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	PPY	P01298	95 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	SCT	P09683	121 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5AC1	P0C628	307 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EFHC1-223	ENST00000636616	CFC1B	P0CG36	223 aa		3.58	□□□□□ -1.84

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