RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUP35Q8NFH5 326 aa9.35□□□□□ -0.91
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 REC114Q7Z4M0 266 aa9.35□□□□□ -0.91
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NBR2O15453 112 aa9.33□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FOSL1P15407 271 aa9.33□□□□□ -0.92
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C11orf71Q6IPW1 123 aa9.33□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WDR73Q6P4I2 378 aa9.33□□□□□ -0.92
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM68Q96MH6 324 aa9.33□□□□□ -0.92
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PAFAH1B2P68402 229 aa9.32□□□□□ -0.92
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C5orf17Q8NAS9 161 aa9.32□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GRAMD2BQ96HH9 432 aa9.32□□□□□ -0.92
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3-23P01764 117 aa9.32□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HLA-DQA1P01909 254 aa9.32□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ESDP10768 282 aa9.32□□□□□ -0.92
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MLST8Q9BVC4 326 aa9.32□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FBXL7Q9UJT9 491 aa9.32□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PS18 150 aa9.31□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPX1P07203 203 aa9.31□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRTN3P24158 256 aa9.31□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BRS3P32247 399 aa9.31□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AMTP48728 403 aa9.31□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa9.31□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa9.31□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNF5Q99942 180 aa9.31□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL4P05112 153 aa9.31□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTDAPP60985 99 aa9.31□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VMO1Q7Z5L0 202 aa9.31□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSKUQ8WUA8 353 aa9.31□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa9.3□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C5orf64Q2M2E5 130 aa9.3□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.3□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GTSF1Q8WW33 167 aa9.3□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NDUFAF3Q9BU61 184 aa9.3□□□□□ -0.92
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
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