RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 CCL17Q92583 94 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 DUX5Q96PT3 197 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 OR8B2Q96RD0 313 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 A0A0U1RQK1 487 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 ZNF320A2RRD8 509 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 FAM231BA6NCW3 169 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 SHISA9B4DS77 424 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 TIMM23O14925 209 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 LIPFP07098 398 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 FABP4P15090 132 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 OR10J1P30954 320 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 DLX6P56179 175 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 TPPP2P59282 170 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 UBE2G2P60604 165 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 ERVFC1-1P60608 527 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 CX3CL1P78423 397 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 PRSS8Q16651 343 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.42□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 K7EQM0 130 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 AVPP01185 164 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 IGLV1-47P01700 117 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 CRYGCP07315 174 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 Q0VG73 95 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 CENPWQ5EE01 88 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 PYY3Q5JQD4 70 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 MUC15Q8N387 334 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 MUC7Q8TAX7 377 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 RPEQ96AT9 228 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 FMC1Q96HJ9 113 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 PAXXQ9BUH6 204 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 THYN1Q9P016 225 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 MUC4Q99102 2169 aa6.41□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 A0A1B0GW15 77 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 E7EQL1 145 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 HYPMO75409 117 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 IGLV2-23P01705 113 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 REG1AP05451 166 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 SELLP14151 372 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 NPPCP23582 126 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 PRTN3P24158 256 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 LGALS4P56470 323 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 RAB4BP61018 213 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 UBE2G1P62253 170 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 SCGB2A2Q13296 93 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 Q6AWC8 147 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 LEAP2Q969E1 77 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
GGA3-218ENST00000584243 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 PSMB11A5LHX3 300 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 PEX7O00628 323 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 TFF1P04155 84 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 AMY1AP04745 511 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 CRISP2P16562 243 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 HTR1DP28221 377 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 BRS3P32247 399 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 RAB9AP51151 201 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 PDE6HQ13956 83 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.39□□□□□ -1.39
GGA3-218ENST00000584243 FAM201AQ5SY85 155 aa6.39□□□□□ -1.39
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