RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 K7EMT4 169 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 GABRPO00591 440 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 HSBP1O75506 76 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 HBE1P02100 147 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 UBBP0CG47 229 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 INAFM2P0DMQ5 153 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 MED21Q13503 144 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF726P1Q15940 193 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC58Q4VC31 144 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 UBE2UQ5VVX9 321 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 TEX43Q6ZNM6 134 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 APRG1Q8IVJ8 170 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 OR4K15Q8NH41 348 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 OR4S2Q8NH73 311 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 OR1L1Q8NH94 360 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 CD300LFQ8TDQ1 290 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 FRZBQ92765 325 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM230Q96A57 120 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 PTX4Q96A99 478 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 TTTY10Q9BZA0 68 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 TAS2R1Q9NYW7 299 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 OR4C45A6NMZ5 311 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 KLLNB2CW77 178 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 PDCD6O75340 191 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 SLC22A5O76082 557 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 MBP02144 154 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 DEFA4P12838 97 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 ELK1P19419 428 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 SRMP19623 302 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 RAB3BP20337 219 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 HLA-DMBP28068 263 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 CEACAM6P40199 344 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 UBE2KP61086 200 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 PRSS8Q16651 343 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM183BQ1AE95 376 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 PLET1Q6UQ28 207 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM183AQ8IXX5 376 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 APH1BQ8WW43 257 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRM-208ENST00000578600 Q96MT0 163 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 OR2A7Q96R45 310 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 TBX5Q99593 518 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 THTPAQ9BU02 230 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 WFDC10AQ9H1F0 79 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 IFI27L2Q9H2X8 130 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
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PTPRM-208ENST00000578600 J3QLW9 94 aa3.59□□□□□ -1.83
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PTPRM-208ENST00000578600 C15orf53Q8NAA6 179 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 OR51G1Q8NGK1 321 aa3.59□□□□□ -1.83
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PTPRM-208ENST00000578600 DSCAML1Q8TD84 2053 aa3.59□□□□□ -1.83
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PTPRM-208ENST00000578600 G3V2T6 193 aa3.58□□□□□ -1.84
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PTPRM-208ENST00000578600 TGOLN2O43493 480 aa3.58□□□□□ -1.84
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PTPRM-208ENST00000578600 SPART-AS1P0CW21 52 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 GNRHRP30968 328 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 CXCL5P42830 114 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 UBE2AP49459 152 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 CDK10Q15131 360 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 KLK9Q2XQG4 91 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 RPL39P5Q59GN2 51 aa3.58□□□□□ -1.84
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