RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 NF1P21359 2839 aa-0.22□□□□□ -2.44
FAM227B-211ENST00000560557 CADP27708 2225 aa-0.22□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 MED13LQ71F56 2210 aa-0.22□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 HMCN2Q8NDA2 5059 aa-0.22□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 OBSL1O75147 1896 aa-0.22□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CECR2Q9BXF3 1484 aa-0.22□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 PDZD2O15018 2839 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 NINQ8N4C6 2090 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ABCA1O95477 2261 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 TIMM17BO60830 172 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 OR2J2O76002 312 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ERC2-IT1O76042 136 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CRYZL1O95825 349 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 HLA-DRB1P01911 266 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ISG15P05161 165 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CD14P08571 375 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CXCL8P10145 99 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 BLVRAP53004 296 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CDC42P60953 191 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CDK6Q00534 326 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 OCIAD2Q56VL3 154 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 SPOPLQ6IQ16 392 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 VMO1Q7Z5L0 202 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ANGPTL5Q86XS5 388 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 C20orf196Q8IYI0 205 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 KRT222Q8N1A0 295 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM86BQ8N661 226 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ANKRD29Q8N6D5 301 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 SLC30A7Q8NEW0 376 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 OR10AG1Q8NH19 301 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 SLAMF6Q96DU3 332 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CCL19Q99731 98 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00467Q9BRT7 94 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 KIFC1Q9BW19 673 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC90BQ9GZT6 254 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 PBOV1Q9GZY1 135 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 DRC3Q9H069 523 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 LPAR5Q9H1C0 372 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 PROK2Q9HC23 129 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CYSLTR1Q9Y271 337 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 HSPG2P98160 4391 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 SPTBN2O15020 2390 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ACANP16112 2415 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 BCL9O00512 1426 aa-0.23□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 KDM6BO15054 1643 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 PKDREJQ9NTG1 2253 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 LRP2P98164 4655 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 KMT2AQ03164 3969 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 MYLKQ15746 1914 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CHD6Q8TD26 2715 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 A0A096LPI6 279 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 A8MWV9 139 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 C1orf196B1AJZ1 125 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 E7EUB6 86 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 H0Y980 276 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 J3QRK9 145 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 M0QZ92 97 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 PIRO00625 290 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CYB5BO43169 146 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 RBP1P09455 135 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 SRP14P37108 136 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 CAV3P56539 151 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 AP3S2P59780 193 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 PSME3P61289 254 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 DYNLT1P63172 113 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 MYL5Q02045 173 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 C8orf74Q6P047 294 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 OR51D1Q8NGF3 324 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 FAM172AQ8WUF8 416 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 SLC35B4Q969S0 331 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 PLEKHB2Q96CS7 222 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 MUCL1Q96DR8 90 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 OR52E6Q96RD3 313 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 PRADC1Q9BSG0 188 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 UBAP1Q9NZ09 502 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 FBXO5Q9UKT4 447 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 F5P12259 2224 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 WNK1Q9H4A3 2382 aa-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
FAM227B-211ENST00000560557 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms