RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 LRTM2Q8N967 370 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 SEC22AQ96IW7 307 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 EHFQ9NZC4 300 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 PAX4O43316 350 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 CRYGDP07320 174 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 RAB3BP20337 219 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 GALR1P47211 349 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 AKR1C2P52895 323 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 ACY3Q96HD9 319 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 IFT46Q9NQC8 304 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 H7BYZ3 331 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 ATG12O94817 140 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 PSG1P11464 419 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 HTR2BP41595 481 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 ASAH1Q13510 395 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 CNBD2Q96M20 576 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 IGLV2-8P01709 118 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 FABP1P07148 127 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 TAS2R20P59543 309 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 LYZP61626 148 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 FABP5Q01469 135 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF738Q8NE65 137 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 NPIPB3Q92617 1050 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 C20orf173Q96LM9 149 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 DIABLOQ9NR28 239 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.47□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 CDKN1BP46527 198 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 SPARTQ8N0X7 666 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 OR52E5Q8NH55 327 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 Q9HAA7 133 aa6.46□□□□□ -1.38
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SMAD3-211ENST00000559460 SCN3BQ9NY72 215 aa6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 ZFP92A6NM28 416 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 OR5AC1P0C628 307 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 MT1HL1P0DM35 61 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 FGL1Q08830 312 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 TDRG1Q3Y452 100 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 NOXA1Q86UR1 476 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 SLC25A22Q9H936 323 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 A0A0U1RQV1 116 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV1-39P01597 117 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV1D-39P04432 117 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 SRIP30626 198 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 S100A7P31151 101 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 RFX2P48378 723 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF415Q09FC8 603 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 SLAQ13239 276 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 PSG3Q16557 428 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 Q6ZTI0 123 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 RSG1Q9BU20 258 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 LRP2P98164 4655 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 SMIM30A4D0T7 59 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.43□□□□□ -1.38
SMAD3-211ENST00000559460 GABARAPH6UMI1 98 aa6.43□□□□□ -1.38
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