RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 PAX1P15863 534 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 PRR31Q5SQ13 230 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 LY6G6FQ5SQ64 297 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 MINOS1Q5TGZ0 78 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 PRSS12P56730 875 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 THADAQ6YHU6 1953 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 UNC13CQ8NB66 2214 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 SPTBN2O15020 2390 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 hDV102S1A0JD36 115 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 CEACAM18A8MTB9 384 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 IAPPP10997 89 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 FSTP19883 344 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV1-2P23083 117 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 LMO1P25800 156 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 IL15RAQ13261 267 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 RRN3P1Q2M238 152 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 ABHD12Q8N2K0 398 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 NABP1Q96AH0 204 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 IL17RELQ6ZVW7 336 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 NEGR1Q7Z3B1 354 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 PAXXQ9BUH6 204 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 CALYQ9NYX4 217 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 SHISA9B4DS77 424 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 IGLC6P0CF74 106 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 IGLL1P15814 213 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 PFN2P35080 140 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 Q6Q795 121 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 TEN1Q86WV5 123 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 RFESDQ8TAC1 157 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 KIR2DL4Q99706 377 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 FOXC2Q99958 501 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 FAM208BQ5VWN6 2430 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 CRLF1O75462 422 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 C8orf88P0DMB2 117 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 FAM236CP0DP71 79 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 INSL4Q14641 139 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 FOXI2Q6ZQN5 318 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 KIR3DL3Q8N743 410 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 NUP35Q8NFH5 326 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 SSMEM1Q8WWF3 244 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00312Q9Y6C7 94 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 RLFQ13129 1914 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 ACACAQ13085 2346 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 IZUMO1RA6ND01 250 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 M0R1W7 72 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 TIRAPP58753 221 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM187Q14656 261 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 VWC2Q2TAL6 325 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 MST1LQ2TV78 715 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 ACP7Q6ZNF0 438 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 FGFRL1Q8N441 504 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF488Q96MN9 340 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 CYTL1Q9NRR1 136 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 RFPL3SP0C7P2 107 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 CNTFRP26992 372 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 TDRG1Q3Y452 100 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 ANK1P16157 1881 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 H3BTX0 84 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 GZMMP51124 257 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 HBBP68871 147 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 ZAR1Q86SH2 424 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 MSRB3Q8IXL7 192 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 CHAC1Q9BUX1 264 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 SPRR3Q9UBC9 169 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 FAM90A26D6RGX4 464 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 H3BP45 60 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 JPT2Q9H910 190 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 EP400Q96L91 3159 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0G2JNJ9 132 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 DUTP33316 252 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 LCN12Q6JVE5 192 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 Q9UFV3 132 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 FRMPD3Q5JV73 1810 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 CACNA1EQ15878 2313 aa5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms