RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540960.1

CHD4-208, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 4, human

TSL 5

Gene CHD4, Length 892 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD4-208	ENST00000540960	YIF1A	O95070	293 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	BRI3	O95415	125 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	MT-ND4L	P03901	98 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	MYOD1	P15172	320 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	GCHFR	P30047	84 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	RAB9A	P51151	201 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	BTN1A1	Q13410	526 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	KLK9	Q2XQG4	91 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	CST9LP1	Q5W188	147 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960		Q8WTZ3	238 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	AJUBA	Q96IF1	538 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	OR4F4	Q96R69	305 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	RARRES2	Q99969	163 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	VSIR	Q9H7M9	311 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	DOK5	Q9P104	306 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	NAT8	Q9UHE5	227 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	ZNF580	Q9UK33	172 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	MUC4	Q99102	2169 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960		I3L2K1	104 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	PPP1R2P9	O14990	202 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	GNG7	O60262	68 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	RD3L	P0DJH9	198 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	CNTFR	P26992	372 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960		Q6ZSV7	163 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960		Q8N9W7	124 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	NECAP1	Q8NC96	275 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	FAM223B	A6NKX1	122 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960		E7EUB6	86 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	FCN1	O00602	326 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	OR7C2	O60412	319 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	PAGE4	O60829	102 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	TOMM40	O96008	361 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	ADCYAP1	P18509	176 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	CEBPG	P53567	150 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	GUCA2B	Q16661	112 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960		Q6YL49	198 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	BIN3	Q9NQY0	253 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	RFNG	Q9Y644	331 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CHD4-208	ENST00000540960	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	FAM74A7	A6NL05	159 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960		C9JQL5	133 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	NDUFB8	O95169	186 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	REG1A	P05451	166 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	IGLC1	P0CG04	106 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	S100P	P25815	95 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	MEOX2	P50222	304 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	DLX1	P56177	255 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	C11orf52	Q96A22	123 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	USMG5	Q96IX5	58 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	OR5B12	Q96R08	314 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	ASCL2	Q99929	193 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	PAXX	Q9BUH6	204 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	OR51M1	Q9H341	326 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
CHD4-208	ENST00000540960	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		6.51	□□□□□ -1.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms