RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516222.1

RNU6-561P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 561, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-561P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-561P-201ENST00000516222 A8MWV9 139 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 C17orf112F2Z3M2 114 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 ORM1P02763 201 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 CCL2P13500 99 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 MT4P47944 62 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 PPP1R1AQ13522 171 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 ZNF56Q15929 161 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 PRADC1Q9BSG0 188 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-561P-201ENST00000516222 FAT1Q14517 4588 aa-1.47□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 RFX7Q2KHR2 1363 aa-1.47□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 MIA2Q96PC5 1412 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 A0A087WSZ3 146 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 A0A096LPI6 279 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 MYL12AP19105 171 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 PPIBP23284 216 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 FBXO48Q5FWF7 155 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 CD302Q8IX05 232 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 MSANTD3Q96H12 275 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 GGACTQ9BVM4 153 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 RABL2BQ9UNT1 228 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 CYSLTR1Q9Y271 337 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 WNK1Q9H4A3 2382 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 TANC1Q9C0D5 1861 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 HERC2O95714 4834 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 CHD6Q8TD26 2715 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 SOGA1O94964 1423 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 MCRIP1C9JLW8 97 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 M0R233 179 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 CLDN12P56749 244 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 CST9Q5W186 159 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 COMMD7Q86VX2 200 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR51A2Q8NGJ7 313 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 RAB37Q96AX2 223 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 MALSU1Q96EH3 234 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 POFUT2Q9Y2G5 429 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 C15orf41Q9Y2V0 281 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 MYLKQ15746 1914 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 NHSL1Q5SYE7 1610 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 CSMD3Q7Z407 3707 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 A0A0J9YY99 117 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 F8VZ95 297 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 HPGDSO60760 199 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR2J2O76002 312 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 ISG15P05161 165 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 CCDC172P0C7W6 258 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 PET100P0DJ07 73 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 SDHAF4Q5VUM1 108 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR52R1Q8NGF1 315 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR10K1Q8NGX5 313 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 DDI1Q8WTU0 396 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 SMIM19Q96E16 107 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 LIMD2Q9BT23 127 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 VWFP04275 2813 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 DOCK4Q8N1I0 1966 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 TRAV27A0A087WT01 109 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 J3QRK9 145 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 SSNA1O43805 119 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 HLA-DRB1P01911 266 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 APOA1P02647 267 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 MYL5Q02045 173 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 ARPINQ7Z6K5 226 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 KLK6Q92876 244 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 A0A096LNT2 108 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 C1orf196B1AJZ1 125 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 BIRC5O15392 142 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 IGHV3-33P01772 117 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 SPAG11BQ08648 103 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 WFDC2Q14508 124 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 FUNDC1Q8IVP5 155 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 KRT222Q8N1A0 295 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 FAM172AQ8WUF8 416 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 LINC00208Q96KT6 92 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 KCTD7Q96MP8 289 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 BSNQ9UPA5 3926 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 MED13LQ71F56 2210 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 SPTBN2O15020 2390 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR10J4P0C629 311 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 AP3S2P59780 193 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 RAB5BP61020 215 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 C1orf134Q5TEV5 83 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 C1orf195Q5TG92 126 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 S100A7AQ86SG5 101 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 C3orf18Q9UK00 162 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 FBXO5Q9UKT4 447 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-561P-201ENST00000516222 CADP27708 2225 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-561P-201ENST00000516222 NUP155O75694 1391 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-561P-201ENST00000516222 F2Z2F3 143 aa-1.54□□□□□ -2.66
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