RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM120AOSQ5T036 256 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 S100A7AQ86SG5 101 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 SIRPDQ9H106 197 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLV2-8P01709 118 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM68Q96MH6 324 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM208BQ5VWN6 2430 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC00587B1AMM8 73 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 UBE2E1P51965 193 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 C9orf152Q5JTZ5 239 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 WDR73Q6P4I2 378 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 NUDT11Q96G61 164 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 GPR82Q96P67 336 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 CCL19Q99731 98 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 ATG101Q9BSB4 218 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 CAMPP49913 170 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 LMO4P61968 165 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 NDPQ00604 133 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 PRNTQ86SH4 94 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM168AQ92567 244 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 GNB4Q9HAV0 340 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 OR2T8A6NH00 312 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 SCGB1D1O95968 90 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 GP9P14770 177 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 ATP5J2P56134 94 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 PLP1P60201 277 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 TBX15Q96SF7 602 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 NDUFB8O95169 186 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV4-39P01824 125 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 TCRAP04437 139 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 PRO1933Q9H354 126 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 K7EQM0 130 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 P01737 135 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 OTORQ9NRC9 128 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 RNF24Q9Y225 148 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 TOMM40O96008 361 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 CLEC2AQ6UVW9 174 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 MS4A10Q96PG2 267 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 NPIPB5A8MRT5 1133 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 NPFFO15130 113 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 HLA-DRB1P01911 266 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 MT-ND6P03923 174 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 PAX2Q02962 417 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 FMC1Q96HJ9 113 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 C17orf77Q96MU5 243 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 MYO18BQ8IUG5 2567 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 AMY1AP04745 511 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 COL8A1P27658 744 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 COX19Q49B96 90 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM219Q86XT9 240 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV20A0A0B4J274 112 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF253O75346 499 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 BRD3OSQ6XYD6 125 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 TSTD3H0UI37 97 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 GPR183P32249 361 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 GBGT1Q8N5D6 347 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 Q8N9W7 124 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 HIGD1CA8MV81 97 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-208ENST00000510829 HLA-DQA1P01909 254 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.7 ms