RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483164.5

GIGYF2-238, Transcript of GRB10 interacting GYF protein 2, human

TSL 5

Gene GIGYF2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIGYF2-238	ENST00000483164	MCEE	Q96PE7	176 aa		3.35	□□□□□ -1.87
GIGYF2-238	ENST00000483164	MYO10	Q9HD67	2058 aa		3.35	□□□□□ -1.87
GIGYF2-238	ENST00000483164	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		3.35	□□□□□ -1.87
GIGYF2-238	ENST00000483164	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
GIGYF2-238	ENST00000483164	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		3.35	□□□□□ -1.87
GIGYF2-238	ENST00000483164	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
GIGYF2-238	ENST00000483164	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		3.34	□□□□□ -1.87
GIGYF2-238	ENST00000483164	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		3.34	□□□□□ -1.87
GIGYF2-238	ENST00000483164	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		3.34	□□□□□ -1.87
GIGYF2-238	ENST00000483164	GGTLC3	B5MD39	225 aa		3.34	□□□□□ -1.87
GIGYF2-238	ENST00000483164		H3BT86	120 aa		3.34	□□□□□ -1.87
GIGYF2-238	ENST00000483164	TP53I11	O14683	189 aa		3.34	□□□□□ -1.87
GIGYF2-238	ENST00000483164	MT-ND4L	P03901	98 aa		3.34	□□□□□ -1.87
GIGYF2-238	ENST00000483164	COX6A1	P12074	109 aa		3.34	□□□□□ -1.87
GIGYF2-238	ENST00000483164	FXYD2	P54710	66 aa		3.34	□□□□□ -1.87
GIGYF2-238	ENST00000483164	QRFP	P83859	136 aa		3.34	□□□□□ -1.87
GIGYF2-238	ENST00000483164	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		3.34	□□□□□ -1.87
GIGYF2-238	ENST00000483164	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		3.34	□□□□□ -1.87
GIGYF2-238	ENST00000483164	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		3.34	□□□□□ -1.87
GIGYF2-238	ENST00000483164	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
GIGYF2-238	ENST00000483164	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		3.34	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		3.34	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		3.33	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	C9orf170	A2RU37	121 aa		3.33	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	CRYGS	P22914	178 aa		3.33	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	COPZ1	P61923	177 aa		3.33	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	NEDD8	Q15843	81 aa		3.33	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	TAF9	Q16594	264 aa		3.33	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		3.33	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		3.33	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		3.33	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		3.33	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		3.33	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		3.33	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	ATRX	P46100	2492 aa		3.33	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		3.33	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		3.32	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		3.32	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	GNG7	O60262	68 aa		3.32	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	IGLC6	P0CF74	106 aa		3.32	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	SMIM6	P0DI80	62 aa		3.32	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	KHDC3L	Q587J8	217 aa		3.32	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		3.32	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	LYPD6	Q86Y78	171 aa		3.32	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	C3orf56	Q8N813	242 aa		3.32	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		3.32	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	BRK1	Q8WUW1	75 aa		3.32	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		3.32	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	GNG8	Q9UK08	70 aa		3.32	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		3.32	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		3.32	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	PTPRS	Q13332	1948 aa		3.31	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		3.31	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		3.31	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	GNRH2	O43555	120 aa		3.31	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	LINC00694	P0DN24	101 aa		3.31	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	FOXF1	Q12946	379 aa		3.31	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	EBI3	Q14213	229 aa		3.31	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		3.31	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	FGF13	Q92913	245 aa		3.31	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	ZNF714	Q96N38	554 aa		3.31	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	OR8B2	Q96RD0	313 aa		3.31	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		3.31	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	OR2T8	A6NH00	312 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164		H7C2G1	150 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	NPFF	O15130	113 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	PSCA	O43653	123 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	TEX29	Q8N6K0	151 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164		Q8N9L7	120 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	MORN4	Q8NDC4	146 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	PRELID3A	Q96N28	172 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	DUSP21	Q9H596	190 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	LCT	P09848	1927 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GIGYF2-238	ENST00000483164	GRIN2A	Q12879	1464 aa		3.29	□□□□□ -1.88

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