RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476089.1

ITGA4-207, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA4, Length 1,846 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-207ENST00000476089 LEMD1Q68G75 181 aa15.96■□□□□ 0.15
ITGA4-207ENST00000476089 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ITGA4-207ENST00000476089 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ITGA4-207ENST00000476089 TSPAN4O14817 238 aa15.96■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa15.96■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 CHRDL1Q9BU40 450 aa15.96■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 BRI3O95415 125 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 PPIFP30405 207 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 S100A7P31151 101 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 TPPP2P59282 170 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 ADIRFQ15847 76 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 CLEC19AQ6UXS0 136 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 ZNF600Q6ZNG1 722 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 Q6ZS46 218 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 ATP6V0BQ99437 205 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 PRDM13Q9H4Q3 707 aa15.95■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 A0A087WWC5 75 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 H3BRN7 92 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 NBEAP1P0C6P0 100 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 GP9P14770 177 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 C11orf52Q96A22 123 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 CCDC140Q96MF4 163 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 GNB4Q9HAV0 340 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 TMEM14CQ9P0S9 112 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 ZNF580Q9UK33 172 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 RNF24Q9Y225 148 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 GGTLC3B5MD39 225 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 ADMP35318 185 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 BLNKQ8WV28 456 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 USMG5Q96IX5 58 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 PRELID1Q9Y255 219 aa15.94■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 ITPR3Q14573 2671 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 BMPR1BO00238 502 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 SRP14P37108 136 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 DERL1Q9BUN8 251 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 TUBA4BQ9H853 241 aa15.93■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 PDZD2O15018 2839 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 CCDC168Q8NDH2 2452 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 TGOLN2O43493 480 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 PF4V1P10720 104 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 CRYBB3P26998 211 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 RPL23P62829 140 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 PRSS22Q9GZN4 317 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 RABAC1Q9UI14 185 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 TEX15Q9BXT5 2789 aa15.92■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 RANP62826 216 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 RELQ04864 619 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 OR4F17Q8NGA8 305 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 UNC79Q9P2D8 2635 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 ZNF98A6NK75 572 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 CD5LO43866 347 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 IL17RELQ6ZVW7 336 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 TCEAL7Q9BRU2 100 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa15.91■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa15.9■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 ZNF343Q6P1L6 599 aa15.9■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 C15orf54Q8N8G6 183 aa15.9■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 ELOVL1Q9BW60 279 aa15.9■□□□□ 0.14
ITGA4-207ENST00000476089 A0A0G2JLM5 398 aa15.89■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 IGLV1-40P01703 118 aa15.89■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 MT-ND4LP03901 98 aa15.89■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 ZNF329Q86UD4 541 aa15.89■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa15.89■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 HELTA6NFD8 242 aa15.89■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 RPL35P42766 123 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 TOMM20LQ6UXN7 152 aa15.89■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 PGPA6NDG6 321 aa15.88■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 CFHR3Q02985 330 aa15.88■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 LINC01551Q86U37 167 aa15.88■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 ISOC2Q96AB3 205 aa15.88■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 CTDSP1Q9GZU7 261 aa15.88■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 YAE1D1Q9NRH1 226 aa15.88■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 TMEM242Q9NWH2 141 aa15.88■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 ITPR2Q14571 2701 aa15.87■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 ZFHX3Q15911 3703 aa15.87■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 CXorf65A6NEN9 183 aa15.87■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 ARL3P36405 182 aa15.87■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 TMEM95Q3KNT9 176 aa15.87■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 RNF212Q495C1 297 aa15.87■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 ZNF586Q9NXT0 402 aa15.87■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 C9JCJ5 164 aa15.87■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 HNF1AP20823 631 aa15.87■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 RAB9AP51151 201 aa15.87■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 C2CD4CQ8TF44 421 aa15.87■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 HIST1H2BAQ96A08 127 aa15.87■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 KLK15Q9H2R5 256 aa15.87■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 PPP5D1E7EU14 171 aa15.86■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 H3BTX0 84 aa15.86■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 CLDN34H7C241 214 aa15.86■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 RPL7P18124 248 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 MYCNOSP40205 109 aa15.86■□□□□ 0.13
ITGA4-207ENST00000476089 TMEM86BQ8N661 226 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms