RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429561.1

SHANK2-AS1-201, SHANK2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SHANK2-AS1, Length 2,252 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 RAB29O14966 203 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 BRI3O95415 125 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 LINC00310P59036 64 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 LTC4SQ16873 150 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 CT45A1Q5HYN5 189 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 OR10X1Q8NGY0 326 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 CT45A3Q8NHU0 189 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 UBALD1Q8TB05 177 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 DPM3Q9P2X0 92 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 AKAP9Q99996 3911 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 CSMD1Q96PZ7 3565 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 NPFFO15130 113 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 AVPP01185 164 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 P0C879 139 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 COX7A1P24310 79 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 PLP1P60201 277 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 KRTDAPP60985 99 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 FAM120AOSQ5T036 256 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 TRAV40A0A0B4J280 105 aa8.97□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 VWC2Q2TAL6 325 aa8.97□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa8.97□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 OR10P1Q8NGE3 313 aa8.97□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 S1PR3Q99500 378 aa8.97□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.97□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.97□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 LY6LH3BQJ8 138 aa8.97□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 PAGE4O60829 102 aa8.97□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 SERF1AO75920 110 aa8.97□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 ZNF134P52741 427 aa8.97□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 ZNF645Q8N7E2 425 aa8.97□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.97□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa8.97□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.97□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.97□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.96□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 GAGE10A6NGK3 116 aa8.96□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 ZNF253O75346 499 aa8.96□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.96□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.96□□□□□ -0.97
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.96□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 A0A1W2PPV4 95 aa8.96□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 C11orf94C9JXX5 98 aa8.96□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 REG1AP05451 166 aa8.96□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 GPX1P07203 203 aa8.96□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 SAA4P35542 130 aa8.96□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 GPR12P47775 334 aa8.96□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 CATR1Q13166 79 aa8.96□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 KLRD1Q13241 179 aa8.96□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 COX19Q49B96 90 aa8.96□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.96□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 LEAP2Q969E1 77 aa8.96□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.96□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 ABCA2Q9BZC7 2435 aa8.95□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 TEX15Q9BXT5 2789 aa8.95□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.95□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 HSD52Q0P140 79 aa8.95□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 Q0VG73 95 aa8.95□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 RPEQ96AT9 228 aa8.95□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 DERL1Q9BUN8 251 aa8.95□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 OR2D2Q9H210 308 aa8.95□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 RNF114Q9Y508 228 aa8.95□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 VPS13CQ709C8 3753 aa8.95□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 CNIH1O95406 144 aa8.94□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 KRASP01116 189 aa8.94□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 NPPCP23582 126 aa8.94□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 ADMP35318 185 aa8.94□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 G6PCP35575 357 aa8.94□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 FOXL1Q12952 345 aa8.94□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 PMCHL1Q16048 86 aa8.94□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.94□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 FAM78BQ5VT40 261 aa8.94□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.94□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.94□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.94□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.94□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 M0R1X1 148 aa8.94□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 MPV17L2Q567V2 206 aa8.94□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 UTF1Q5T230 341 aa8.94□□□□□ -0.98
SHANK2-AS1-201ENST00000429561 HARBI1Q96MB7 349 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.9 ms