RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 MAGEA5P43359 124 aa9.96□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 LGALS9BQ3B8N2 356 aa9.96□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.96□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 GTSCR1Q86UQ5 136 aa9.96□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 ASCL2Q99929 193 aa9.96□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM160Q9NX00 188 aa9.96□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 PRCDQ00LT1 54 aa9.96□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.96□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 IMMP1LQ96LU5 166 aa9.96□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 HARBI1Q96MB7 349 aa9.96□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 Q9H3A6 140 aa9.96□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 INSIG2Q9Y5U4 225 aa9.96□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 CFAP54Q96N23 3096 aa9.96□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 HCFC1P51610 2035 aa9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 H3BVH4 76 aa9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 PROP1O75360 226 aa9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 DKK1O94907 266 aa9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 OR1L8Q8NGR8 309 aa9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM14BQ9NUH8 114 aa9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 CALYQ9NYX4 217 aa9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 DKK2Q9UBU2 259 aa9.96□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 ORMDL3Q8N138 153 aa9.95□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 C20orf78Q9BR46 151 aa9.95□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 DYSFO75923 2080 aa9.95□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 NPIPB6E9PJ23 425 aa9.95□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 FAM106CPP0CH98 169 aa9.95□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 LYZP61626 148 aa9.95□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.95□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa9.95□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 COL4A2P08572 1712 aa9.95□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 PRR33A8MZF0 331 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 FNDC10F2Z333 226 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 LTAP01374 205 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 TCRAP04437 139 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF134P52741 427 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 CACNG8Q8WXS5 425 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 A0A1W2PQM1 296 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 B5MCH6 92 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 UPK2O00526 184 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 FGF6P10767 208 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 CT83Q5H943 113 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 HCP5Q6MZN7 132 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 FOXC2Q99958 501 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.94□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 ENSAO43768 121 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 INSL3P51460 131 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 C2orf83Q53S99 150 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 AMN1Q8IY45 258 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 DPF1Q92782 380 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 FXYD5Q96DB9 178 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 HAX1O00165 279 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 CCL4P13236 92 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM189A5PLL7 270 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 SCGB2A1O75556 95 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 ROS1P08922 2347 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 ARL3P36405 182 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 TWIST1Q15672 202 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 TEX29Q8N6K0 151 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM178AQ8NBL3 297 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 RNF183Q96D59 192 aa9.93□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 PINLYPA6NC86 204 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 IGLL5B9A064 214 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 SMKR1H3BMG3 65 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 AGFG2O95081 481 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 PRR14LQ5THK1 2151 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 IL4P05112 153 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 SCGB1C2P0DMR2 95 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 PSMB2P49721 201 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 ABHD17AQ96GS6 310 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 SPATA25Q9BR10 227 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 DEFB127Q9H1M4 99 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 IGLV3-19P01714 112 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 IGKV1-16P04430 117 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 CLEC3BP05452 202 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms