RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347055.3

KRCC1-201, Transcript of lysine rich coiled-coil 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KRCC1, Length 1,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1-201ENST00000347055 RPRMLQ8N4K4 120 aa14.55□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 NUP37Q8NFH4 326 aa14.55□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 EYSQ5T1H1 3165 aa14.55□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 OVOL3O00110 214 aa14.55□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 FA2HQ7L5A8 372 aa14.55□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 OR9G4Q8NGQ1 327 aa14.55□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 C7orf71A4D174 169 aa14.54□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 CBY3A6NI87 242 aa14.54□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 PLAUP00749 431 aa14.54□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 IGLV2-11P01706 119 aa14.54□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 LGALS9BQ3B8N2 356 aa14.54□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 LGALS9CQ6DKI2 356 aa14.54□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 DEFB108BQ8NET1 73 aa14.54□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa14.54□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa14.54□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.54□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa14.54□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 K7EQM0 130 aa14.53□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 HES3Q5TGS1 186 aa14.53□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 UFSP1Q6NVU6 142 aa14.53□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 CSTL1Q9H114 145 aa14.53□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 PRO3102Q9H379 93 aa14.53□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 ZNRD1Q9P1U0 126 aa14.53□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 A0A087X0K7 114 aa14.52□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.52□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.52□□□□□ -0.08
KRCC1-201ENST00000347055 CFAP54Q96N23 3096 aa14.52□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 PRR14LQ5THK1 2151 aa14.52□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 HSD52Q0P140 79 aa14.52□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa14.52□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 VHLLQ6RSH7 139 aa14.52□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 TNFRSF14Q92956 283 aa14.52□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 U3KQK5 164 aa14.52□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa14.51□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 GAGE10A6NGK3 116 aa14.51□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 C9orf118A6NHY6 69 aa14.51□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 THBDP07204 575 aa14.51□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 FGF6P10767 208 aa14.51□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 TMEM200BQ69YZ2 307 aa14.51□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 SEM1Q6ZVN7 128 aa14.51□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 FDCSPQ8NFU4 85 aa14.51□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 OR4X2Q8NGF9 303 aa14.51□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 AP1S3Q96PC3 154 aa14.51□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 SLC25A17O43808 307 aa14.5□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 RBPJQ06330 500 aa14.5□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 BOD1L2Q8IYS8 172 aa14.5□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa14.5□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 SGK494Q96LW2 274 aa14.5□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa14.5□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 CRYGBP07316 175 aa14.5□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 LPAL2Q16609 132 aa14.5□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 PLA2G2CQ5R387 149 aa14.5□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.5□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 TP73-AS1Q9UF72 201 aa14.5□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 TNCP24821 2201 aa14.49□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 DHRS13Q6UX07 377 aa14.49□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 S100A7AQ86SG5 101 aa14.49□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 PRNTQ86SH4 94 aa14.49□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 PIFOQ8TCI5 191 aa14.49□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 CT45A10P0DMU9 189 aa14.48□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 CCL3L1P16619 93 aa14.48□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 CD24P25063 80 aa14.48□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 CCL11P51671 97 aa14.48□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 OR5A1Q8NGJ0 315 aa14.48□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 K7EM74 188 aa14.47□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 K7EP34 96 aa14.47□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 NDUFB3O43676 98 aa14.47□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 ARMS2P0C7Q2 107 aa14.47□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa14.47□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 ZADH2Q8N4Q0 377 aa14.47□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 TRBV19A0A075B6N1 114 aa14.47□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 IGHV3-48P01763 117 aa14.47□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 CD40P25942 277 aa14.47□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 DLX6P56179 175 aa14.47□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 PPIAL4EA0A075B759 164 aa14.46□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 SHISA9B4DS77 424 aa14.46□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 PPIAL4DF5H284 164 aa14.46□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 PPIAL4FP0DN26 164 aa14.46□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF138P52744 262 aa14.46□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 PSG3Q16557 428 aa14.46□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 LINC01559Q495D7 138 aa14.46□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 COX8CQ7Z4L0 72 aa14.46□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa14.46□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa14.46□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa14.46□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
KRCC1-201ENST00000347055 NGBQ9NPG2 151 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms