RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 RAB9AP51151 201 aa11.93□□□□□ -0.5
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CCNDBP1-201ENST00000300213 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
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CCNDBP1-201ENST00000300213 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM231DQ6ZW35 169 aa11.88□□□□□ -0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 GTSCR1Q86UQ5 136 aa11.88□□□□□ -0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 AMN1Q8IY45 258 aa11.88□□□□□ -0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRELID3AQ96N28 172 aa11.88□□□□□ -0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATP6V0BQ99437 205 aa11.88□□□□□ -0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 C19orf24Q9BVV8 132 aa11.88□□□□□ -0.51
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CCNDBP1-201ENST00000300213 CT45A6P0DMU7 189 aa11.88□□□□□ -0.51
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